换一批
换一批大豆膨胀素基因GmEXPB5 和GmEXPB7生物信息学及表达分析
Bioinformatics and expression analysis of expansin genes GmEXPB5 and GmEXPB7 in soybean
摘要：
膨胀素(expansin,EXP)通过调控细胞壁的松弛在植物应对环境胁迫过程中起着重要作用.为研究EXP基因在大豆应对非生物胁迫过程中的作用,该文对大豆中的两个EXP基因(GmEXPB5 和GmEXPB7)及其蛋白序列进行生物信息学分析,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测基因表达量.结果表明:(1)GmEXPB5 和GmEXPB7 分别位于大豆第 10 号和第 12 号染色体上,编码的蛋白序列长度分别为 272 和 267个氨基酸.GmEXPB5 蛋白分子量为 29.07 kD,理论等电点为 7.51;GmEXPB7 蛋白分子量为 29.09 kD,理论等电点为 8.66.GmEXPB5 和GmEXPB7 均为稳定的亲水蛋白且定位于细胞壁中.GmEXPB5 和GmEXPB7蛋白均含有一段信号肽序列和一个保守的DPBB_1 结构域.(2)GmEXPB5 蛋白与鹰嘴豆CaEXPB15 蛋白亲缘关系最近,GmEXPB7 蛋白与密花豆、赤豆和豇豆的EXPB3 蛋白有着较近的亲缘关系.(3)GmEXPB5和GmEXPB7 在大豆根、茎和叶中均有表达且它们在根和叶中的表达量均显著高于茎中的表达量.(4)GmEXPB5 和GmEXPB7 在大豆幼苗中可以响应盐、干旱和低温胁迫.(5)GmEXPB5 启动子区域含有 2 种与逆境相关的顺式作用元件(ABRE和ARE);GmEXPB7 启动子区域含有 5 种与逆境相关的顺式作用元件(ABRE、ARE、CGTCA-motif、TC-rich repeats和MBS).综上所述,GmEXPB5 和GmEXPB7 能够参与大豆对非生物胁迫的应答.
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作者：
作者单位：
齐齐哈尔大学 生命科学与农林学院,黑龙江 齐齐哈尔 161006
[1]
黑龙江省农业科学院畜牧兽医分院,黑龙江 齐齐哈尔 161005
[2]
黑龙江省农业科学院克山分院,黑龙江 齐齐哈尔 161606
[3]
期刊：
《广西植物》2024年44卷7期 1289-1298页
ISTICPKUCSCD
关键词：
大豆膨胀素生物信息学分析非生物胁迫表达分析soybean(Glycine max)expansinbioinformatics analysisabiotic stressexpression analysis
分类号：
Q943
栏目名称：
遗传与育种
DOI：
10.11931/guihaia.gxzw202309018
发布时间：
2024-08-20
基金项目：
国家自然科学基金
黑龙江省省属高等学校基本科研业务费科研项目
高教强省科研专项科技成果产业化攻关项目
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