换一批
换一批文库构建与基因簇靶向筛选驱动的微生物天然产物高效发现
Library construction and targeted BGC screening for more efficient discovery of microbial natural products
摘要：
微生物天然产物作为小分子药物的主要来源,已被广泛应用于医药与农业等领域.随着全球抗生素耐药性与其他公共健康问题的加剧,新结构、新靶点微生物天然产物发现迫在眉睫.大规模(宏)基因组测序揭示微生物蕴含了巨大的生物合成潜力,相继催生了多种不同类型的天然产物挖掘策略.然而,目前仍然缺乏将天然产物合成基因簇与编码产物快速关联的高效方案.近年来,(宏)基因组文库构建在获取批量天然产物合成基因簇方面展现出明显优势,结合高效的基因簇靶向筛选方法,显著加速了新结构天然产物系统发现.本文综述了三类基于(宏)基因组文库构建与靶向筛选驱动天然产物创新发现的策略,主要从克隆载体类型、文库构建方式、基因簇靶向筛选方法等角度进行了阐述,并对Cosmid/Fosmid文库、BAC/PAC文库、FAC/YAC文库等不同文库类型的优缺点及应用范围进行了对比,最后对这些策略的发展前景进行了展望.未来,基于文库构建与基因簇靶向筛选策略将极大驱动不同生境微生物来源的活性天然产物挖掘,预期大量新靶点、新结构天然产物将不断涌现.
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作者：
作者单位：
上海交通大学生命科学技术学院,微生物代谢国家重点实验室,上海 200240;华东理工大学生物工程学院,生物反应器工程国家重点实验室,上海 200237
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华东理工大学生物工程学院,生物反应器工程国家重点实验室,上海 200237
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上海交通大学生命科学技术学院,微生物代谢国家重点实验室,上海 200240
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关键词：
微生物天然产物(宏)基因组挖掘基因簇文库构建基因簇靶向筛选microbial natural products(meta)genomic miningbiosynthetic gene clusterlibrary constructiontargeted BGC screening
分类号：
Q819
栏目名称：
特约评述
DOI：
10.12211/2096-8280.2023-083
发布时间：
2024-07-24
基金项目：
国家重点研发计划
国家重点研发计划
国家自然科学基金
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