换一批
换一批基于DE-3D U-Net的斑马鱼后脑血管共聚焦显微图像分割和量化测量
Segmentation and Quantification of Zebrafish Hindbrain Vessel Confocal Images Based on DE-3D U-Net
摘要：
斑马鱼后脑部位的脉络丛控制着大脑和血管之间的物质交换,脉络丛周围的血管异常可引发相关的脑血管疾病.本文首先对斑马鱼后脑部位的主要血管进行了连续成像,使用共聚焦显微镜拍摄正常情况和柱孢藻毒素处理后的斑马鱼胚胎,获得了斑马鱼在受精后43～63 h的系列三维图像.然后,进一步开发了图像分割的神经网络DE-3D U-Net 用于主要后脑血管的分割.网络分割结果显示,3根主要血管的类别像素准确率分别为86.67%、93.18%和83.74%.最后,绘制了斑马鱼后脑血管发育曲线图.结果表明,3根主要的血管半径在高浓度的柱孢藻毒素处理后出现了18%左右的缩减,中脑静脉夹角出现了30°～50°的缩减.此研究提出了一个可用于斑马鱼后脑血管分割的神经网络模型,得出的数据可为斑马鱼脉络丛发育研究提供基础.
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作者：
期刊：
《激光生物学报》2024年33卷3期 209-216页
ISTIC
关键词：
斑马鱼后脑血管共聚焦显微成像3D U-Net神经网络柱孢藻毒素zebrafishhindbrain vesselsconfocal microscopy3D U-Net deep-learning networkcylindrospermopsin
分类号：
TP391
栏目名称：
研究论文
DOI：
10.3969/j.issn.1007-7146.2024.03.003
发布时间：
2024-07-10
基金项目：
国家自然科学基金
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