换一批
换一批国产遗传分析仪测序模块优化设计研究
Optimization Design of Sequencing Module for Domestic Genetic Analyzer
摘要：
本文使用国产24道遗传分析仪搭配国产36 cm毛细管阵列,解决无胶筛分毛细管电泳技术为基础的遗传分析仪在测序中荧光信号校正、运行电压、迁移校正问题.以24道遗传分析仪原始光谱荧光信号为基础,建立光谱校正模型,获得基线噪声阈值.通过运行电压与峰间距值绘制标准曲线,利用测序分析软件计算清晰片段长度,确定最佳运行电压和峰间距,进而计算迁移偏移值,建立碱基大小与迁移时间的线性模型,实现碱基的准确识别.研究表明,在合适的光谱校正和基线噪声阈值限制下,当运行电压设置为10 kV,峰间距为13.05帧时,分析仪的最长清晰片段检验能力最强,为561 bp.通过迁移修正值的补偿,建立碱基大小与迁移时间的线性模型,碱基G、A、T、C的R2(标准曲线)值分别从0.992 7、0.992 7、0.994 5、0.987 9提高到0.999 6、0.999 8、0.999 6、0.999 7,且修正后,各个荧光标记的碱基均能得到正确标记,无漏标和错标,清晰片段长度延长到621 bp.本研究可以指导国产遗传分析仪测序模块的优化和设计,使分析仪的DNA碱基识别功能更高效和准确.
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作者：
作者单位：
公安部第一研究所,北京 100048
[1]
公安部鉴定中心,北京 100038;西安交通大学生物证据研究院,国家生物安全证据基地,西安 710049
[2]
北京中盾安民分析技术有限公司,北京 102200
[3]
期刊：
《激光生物学报》2024年33卷3期 217-226页
ISTIC
关键词：
国产遗传分析仪无胶筛分毛细管电泳碱基测序运行电压迁移校正domestic genetic analyzernon-gel capillary electrophoresisbase sequencingrun voltagemigration correction
分类号：
R394-33
栏目名称：
研究论文
DOI：
10.3969/j.issn.1007-7146.2024.03.004
发布时间：
2024-07-10
基金项目：
国家自然科学基金
国家重点研发计划
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目
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