换一批
换一批种植体周围炎中铁死亡的生物信息学分析与实验验证
Bioinformatics analysis and experimental validation of ferroptosis in peri-implantitis
摘要：
目的 探究种植体周围炎中与铁死亡相关的关键基因,探究调控种植体周围炎的潜在机制.方法 从GEO数据库中获取多个芯片数据,筛选出差异表达基因,进行GO及KEGG分析,STRING网站构建差异基因PPI网络;利用测试集对关键基因进行验证,并判断关键基因的诊断价值.通过免疫浸润分析获得 22 种免疫细胞在种植体周围炎组织中的含量及比例.对关键基因进行qRT-PCR与Western Blot(WB)验证.结果 种植体周围炎组织与正常牙龈组织共 1 138 个差异基因,其中29 个为铁死亡相关差异基因;种植体周围炎组织的基因表达主要涉及免疫反应激活等过程;铁死亡相关差异基因中的 5 个关键基因,即SOX2、GJA1、IL1B、GPX2 和CHAC1,在种植体周围炎组织中差异表达并有较高诊断价值.免疫浸润分析结果显示,在种植体周围炎组织中记忆B细胞、浆细胞等免疫细胞显著变化.qRT-PCR实验与WB实验证实关键基因mRNA与其转录的蛋白有明显的差异表达.结论 利用生物信息学分析与生物学验证筛选出种植体周围炎和铁死亡间的差异基因,为种植体周围炎的研究提供新思路.
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作者：
期刊：
《口腔医学》2024年44卷7期 527-535页
ISTIC
关键词：
GEO数据库生物信息学种植体周围炎铁死亡差异基因GEO databasebioinformaticsperi-implantitisferroptosisdifferential expressed genes
分类号：
R318.04
栏目名称：
基础与临床研究
DOI：
10.13591/j.cnki.kqyx.2024.07.008
发布时间：
2024-08-20
基金项目：
国家自然科学基金
国家自然科学基金
江苏省自然科学基金
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