换一批
换一批MS4A6A的泛癌分析:基因组特征、免疫浸润和预后
Pan-cancer analysis of MS4A6A and its prognostic value in cancer
摘要：
目的 对4次跨膜蛋白MS4A6A(membrane-spanning 4-domain family,subfamily A,member 6A)在泛癌组织中的转录水平、基因组改变情况、潜在的异常表达机制、预后价值、与免疫细胞及免疫相关基因的关系和潜在的调控机制进行了探索.方法 使用生物信息学方法深入分析MS4A6A基因组、MS4A6A表达与免疫细胞浸润相关性及MS4A6A表达与肿瘤突变负荷、微卫星不稳定性和免疫评分的相关性;基于Spearman相关系数分析免疫评分与MS4A6A表达的相关性.结果 1)对33种肿瘤的单因素Cox分析表明,MS4A6A高基因转录是低级别脑胶质瘤(brain lower grade glioma,LGG)、睾丸生殖细胞瘤(testicular germ cell tumors,TGCT)、葡萄膜黑色素瘤(uveal melanoma,UVM)、胸腺瘤(thymoma,THYM)的危险因素;2)大部分肿瘤MS4A6A甲基化水平与其表达呈负相关,提示MS4A6A差异表达可能与其启动子甲基化相关;3)MS4A6A表达与免疫评分在32种肿瘤中呈现显著正相关,且在所有类型肿瘤中与基质评分和ESTIMATE评分均呈现显著正相关;4)MS4A6A表达与肿瘤相关成纤维细胞、调节性T细胞、B细胞、中性粒细胞、巨噬细胞、单核细胞和CD8+T细胞的浸润呈现正相关.结论 MS4A6A可能通过影响免疫系统进一步参与肿瘤进程调控.
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作者：
作者单位：
400038 重庆,陆军军医大学基础医学院免疫学教研室
[1]
610083 成都,解放军西部战区总医院药剂科
[2]
期刊：
《免疫学杂志》2024年40卷2期 181-187页
ISTICPKUCSCD
分类号：
R392
栏目名称：
技术与方法
DOI：
10.13431/j.cnki.immunol.j.20240025
发布时间：
2024-07-16
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