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基于生物信息学分析肝细胞癌中GNPDA2与免疫相关性

The Correlation Between GNPDA2 and Immunity in Hepatocellular Carcinoma

摘要:

目的:通过生物信息学方法分析泛癌中葡萄糖-6-磷酸脱氨酶2(GlcN6P deaminase 2,GNPDA2)表达水平及免疫相关性;浅显分析肝细胞癌中(Hepatocellular Carcinoma,HCC)DNA甲基化与GNPDA2相关性.方法:利用ULCAN网站分析泛肿瘤中GNPDA2表达水平与生存差异;运用Spearman相关性分析GNPDA2表达与免疫细胞浸润及免疫分子相关性;预测DNA甲基化调节GNPDA2表达能力.结果:HCC中存在GNPDA2表达升高(P<0.001),其过表达可缩短患者生存期(P<0.01);GNPDA2过表达与免疫有关分子存在一定相关性(r>0.1,P<0.05),并促进免疫细胞浸润(r>0.2,P<0.05);DNA低甲基化可上调GNPDA2表达(r=-0.26,P<0.001).结论:HCC中GNPDA2过表达可促进免疫细胞浸润并与DNA甲基化呈负相关.

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作者: 臧翌辰 [1] 薛乐乐 [1] 任祎琳 [1] 杨凯歌 [1] 段余钡 [1] 罗成华 [1] 张海俊 [2] 梁伟华 [1] 沈西华 [2] 胡建明 [1]
期刊: 《农垦医学》2024年46卷2期 125-131页
分类号: R735.7
栏目名称: 基础与临床医学
DOI: 10.3969/j.issn.1008-1127.2024.02.006
发布时间: 2024-07-11
基金项目:
国家自然科学基金
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