基于基因集富集分析阐释补肺益肾方抑制巨噬细胞炎症反应机制
Investigating Interventional Mechanism of Bufei Yishen Formula for Inhibiting Macrophage Inflammatory Response Based on Gene Set Enrichment Analysis
目的 从通路水平探究慢性阻塞性肺疾病有效方药补肺益肾方的干预机制.方法 采用LPS诱导巨噬细胞建立炎症反应模型.基于基因集富集分析(Gene set enrichment analysis,GSEA)方法,筛选巨噬细胞炎症反应相关通路,通过富集评分(Normalized enrichment score,NES)筛选药物干预后发生逆转的通路,揭示补肺益肾方及其配伍的干预机制.结果 补肺益肾方所含中药的NES为-1377.23,其中补肾配伍的为-485.07、活血配伍的为-351.86、化痰配伍的为-303.71、益气配伍的为-236.59;补肺益肾方显著逆转的通路为213条,其中活血配伍的为184条、补肾配伍的为147条、化痰配伍的为134条、益气配伍的为133条,逆转率分别为75.41%、60.25%、54.92%、54.51%.TGF-β production等90条通路在4个配伍中均被显著逆转.Positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response等为配伍特异性逆转通路.结论 补肺益肾方各配伍组逆转炎症信号通路的强度依次为补肾、活血、化痰、益气配伍,逆转通路数量依次为活血、补肾、化痰、益气.补肺益肾方可通过调控各配伍共性及特异性逆转通路干预炎症反应.
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