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基于网络药理学与分子对接探究藏药鬼箭锦鸡儿治疗高原红细胞增多症的分子机制

The molecular mechanism of Tibetan medicine Caragana jubabt Poir in the treatment of high altitude potycythemia based on network pharmacology and molecular docking

摘要:

目的 基于网络药理学、分子对接探讨藏药鬼箭锦鸡儿治疗高原红细胞增多症(high altitude polycythemia,HAPC)的分子机制.方法 通过文献检索寻找鬼箭锦鸡儿的活性成分,采用SwissTargetPrediction数据库预测其潜在靶点,采用OMIM和GeneCards数据库筛选HAPC靶点,并将药物作用靶点和疾病靶点取交集,构建蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks,PPI networks),借助DAVID数据库进行基因功能和通路富集分析,并采用AutoDock软件对关键活性成分和核心靶点进行分子对接,筛选鬼箭锦鸡儿活性成分潜在的作用靶点及相关信号通路.结果 得到鬼箭锦鸡儿的有效活性成分 25 种,成分对应的靶点 401 个.连接度最高的前8 种 化 学 成 分为 7,3',4'-Trihgdroxy flavone、Geraldone、Quercetin、biochanin A、lsorhamnetin、7,?4'-Dihydroxyflavone、Formononetin、Afrormosin.HAPC的疾病靶点共261 个;药物成分与HAPC的交集靶点共 41 个,作用核心靶点包含VEGFA、AKT1、TNF、HAP90AA1、ESR1、MMP9、ACE、F2、CYP3A4、REN;参与的生物过程、细胞复合物、分子功能主要有缺氧反应生物过程、蛋白质磷酸化正调控过程、细胞表面、大分子复合体、类固醇结合、酶结合等;关键信号通路主要涉及Pathways in cancer、Chemical carcinogenesis-receptor activation、Fluid shear stress and atherosclerosis等.分子对接结果显示,8 种主要活性成分与ACE、CYP3A4 的结合情况很好,结合能均小于-8.5 kcal·mol-1.结论 鬼箭锦鸡儿的活性成分可以通过多通路作用于多靶点来治疗HAPC,为基础实验研究和临床应用提供一定的科学依据.

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作者: 刘超 [1] 韩春笋 [1] 于进帅 [1] 李涛 [1] 陈帆 [1] 任建委 [1]
栏目名称: 论著
DOI: 10.12173/j.issn.1004-4337.202403045
发布时间: 2024-08-29
基金项目:
西藏自治区自然科学基金一般项目
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