换一批
换一批家蚕BmAKR基因家族的鉴定及在蚕卵中的表达分析
Genome-wide identification of the BmAKR gene family in the silkworm(Bombyx mori)and their expression analysis in diapause eggs and nondiapause eggs
摘要：
醛酮还原酶超家族(aldo-keto reductase super family,AKRs)具有广泛的底物特异性,目前尚未见对昆虫 AKR 基因家族成员的系统鉴定报道.本研究采用生物信息学手段,预测了家蚕(Bombyx mori)AKR基因的系统进化、理化性质、染色体定位、保守基序和基因结构,通过转录组数据和实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real time polymerase chain reaction,qRT-PCR)分析了不同组织时期及不同发育状态蚕卵中BmAKR基因的表达水平,并采用Western blotting检测了蚕卵中该蛋白的表达量.本研究共鉴定出 11 个BmAKR基因,分布在 4 条不同的染色体上,都具有AKR家族特有的(α/β)8 桶保守结构,理化特征较为相似;系统进化分析显示,其可分为 2 个家族(AKR1和AKR2).转录组数据分析显示,家族成员基因在不同组织时期中的表达差异较大.进一步分析发现,一部分BmAKR基因在非滞育卵的表达量显著高于滞育卵;但BmAKR1-1在滞育卵中的表达量却显著高于非滞育卵.蛋白水平的检测发现BmAKR1-1 在滞育卵和非滞育卵的差异变化趋势与 qRT-PCR结果一致.综上所述,本研究通过对家蚕BmAKR家族的鉴定和分析,筛选出BmAKR1-1等作为调控蚕卵发育的候选基因,以便后期对其进行深入研究.
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作者：
作者单位：
西南大学 资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室,重庆 400715;西南大学蚕桑纺织与生物质科学学院,重庆 400715
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西南大学 资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室,重庆 400715;西南大学 前沿交叉学科研究院生物学研究中心,重庆 400715
[2]
西南大学蚕桑纺织与生物质科学学院,重庆 400715
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期刊：
《生物工程学报》2023年39卷12期 4982-4995页
MEDLINEISTICPKUCSCD
关键词：
家蚕BmAKR基因家族滞育卵表达分析系统进化Bombyx moriBmAKR gene familydiapause eggsexpression analysisphylogenetic evolution
栏目名称：
农业生物技术
DOI：
10.13345/j.cjb.230105
发布时间：
2024-03-19
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