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质粒DNA Fast NGS测序方法的开发和应用

Development and Application of Fast NGS Sequencing Method for Plasmid DNA

摘要:

质粒DNA是最常用的基因运载工具,在基因合成技术中扮演着至关重要的角色.如何实现合成质粒DNA的准确且快速检测,是确保基因组完整性和提高基因合成效率的关键.尽管基于一代DNA的测序方法,其准确性已成为行业标准,但在检测通量、检测速度和检测成本等方面仍然存在局限性,这促使科学家们不断寻求新的解决方案.基于生物酶库,开发了DNA建库酶TN5,建立了高通量质粒DNA检测方案——Fast NGS.利用不同长度、不同质量的质粒DNA样本评估了Fast NGS的可行性,并对质粒DNA样本进行了高通量测序,最后对比了Fast NGS与Sanger测序的效率.结果表明,DNA建库酶TN5蛋白的纯度和质量符合二代测序要求.Fast NGS适用于3~8 kb基因合成质粒的测序检测,其检测通量高达2 500个·12 h-1,测序成功率超过95%,测序准确性与一代测序相当,并且无明显序列偏好性.Fast NGS实现了质粒DNA的高通量、快速且低成本检测,为基因合成技术的发展提供了新的方向.

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作者: 宋辉 [1] 曹文刚 [1] 肖晓文 [1] 杜军 [2]
作者单位: 北京擎科生物科技股份有限公司研究院,北京 100000;湖北擎科生物科技有限公司研发部,湖北 鄂州 431800 [1] 北京擎科生物科技股份有限公司研究院,北京 100000 [2]
分类号: Q819
栏目名称: 研究论文
DOI: 10.19586/j.2095-2341.2024.0039
发布时间: 2024-08-21
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