换一批
换一批结节性甲状腺肿circRNA-miRNA-mRNA调控网络的构建
Construction of circRNA-miRNA-mRNA regulatory network in nodular goiter
摘要：
基于生物信息分析筛选结节性甲状腺肿中差异表达的环状RNA(circRNA),并揭示circRNA-miRNA-mRNA调控网络在结节性甲状腺肿中的作用.从GEO数据库中检索结节性甲状腺肿组织基因芯片数据,利用R软件筛选出差异表达的cir-cRNA.联合多个生物信息数据库预测差异表达circRNA下游的miRNA及mRNA,并对靶mRNA进行GO及KEGG富集分析.利用STRING在线数据库及Cytoscape软件筛选核心基因.确定了 2 个circRNA,42 个miRNA及 546 个mRNA.GO及KEGG富集分析表明靶mRNA主要涉及细胞生长及基因表达调控过程.基于Cytoscape软件筛选出了 14 个核心基因(SP1、IGF1R、RPS6KB1、SMAD2、SMAD3、SMAD4、VEGFA、CCND1、CDK2、HSPA4、HIF1A、CREB1,NR3C1 和 STAT5A).最终基于 2 个circRNA、11 个miRNA和 14 个核心mRNA构建了circRNA-miRNA-mRNA调控网络.结节性甲状腺肿组织中异常表达的cir-cRNA及相关的circRNA-miRNA-mRNA调控网络可能成为结节性甲状腺肿诊断与治疗的新靶点.
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作者：
作者单位：
中国中医科学院西苑医院 综合内科,北京 100091
[1]
期刊：
《生物信息学》2024年22卷2期 109-115页
ISTIC
分类号：
R581
栏目名称：
研究论文
DOI：
10.12113/202301010
发布时间：
2024-07-03
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