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中国野生刺梨的遗传多样性及遗传结构分析

Genetic diversity and genetic structure analysis of wild Chinese Rosa roxburghii Tratt.germplasm resources

摘要:

基于10对EST-SSR引物,对中国8个省29个居群的261份野生刺梨(Rosa roxburghii Tratt.)进行毛细管电泳检测,探究其遗传多样性,并进行聚类分析.结果显示,共扩增出了95个等位基因,位点多态性信息含量(PIC)平均值为0.568;群体水平上,平均等位基因数(NA)和有效等位基因数(NE)分别为3.131和2.331,平均观测杂合度(HO)和预期杂合度(HE)分别为0.508和0.488,平均Shannon's信息指数(I)为0.858,表明野生刺梨种质具有较高的遗传多样性水平.群体遗传分化分析结果显示,平均遗传分化系数(FST)为0.067,基因流(Nm)为4.511,说明刺梨群体间基因流动较频繁.分子方差分析(AMOVA)结果表明刺梨的遗传变异主要来源于居群内(93.64%).各居群间的Nei氏标准遗传距离范围为 0.054~1.269,平均值为0.657,与地理距离表现为显著相关(r=0.467,P<0.000 1).聚类分析和PCA结果均将29个居群分为3个分支.研究结果说明中国野生刺梨资源核心分布区在我国西南地区.

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作者: 刘粉粉 [1] 莫亮团 [2] 欧国腾 [2] 聂怡玫 [2] 牛涛 [2] 黄秦军 [1]
作者单位: 中国林业科学研究院林业研究所,北京 100091 [1] 贵州省黔南州林业局,贵州都匀 558099 [2]
期刊: 《植物科学学报》2024年42卷3期 350-358页 ISTICPKUCSCDBP
分类号: Q943.2
栏目名称: 遗传与育种
DOI: 10.11913/PSJ.2095-0837.23248
发布时间: 2024-07-10
基金项目:
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项
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