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基于网络药理学和分子对接技术的血必净注射液治疗脓毒症的机制研究

Mechanism of Xuebijing Injection in the treatment of sepsis based on network pharmacology and molecular docking

摘要:

目的 基于网络药理学和分子对接技术,探讨血必净注射液治疗脓毒症的潜在作用机制.方法 利用Swiss Target Prediction和TCMSP数据库预测血必净注射液的药物成分和作用靶点,筛选核心成分;利用STITCH、DisGeNET和Genecards数据库预测脓毒症作用靶点,使用Venny 2.1.0工具将药物与疾病靶点映射得到二者交集靶点,进而构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选出核心作用靶点;利用DAVID数据库进行KEGG和GO富集分析获取相关通路,依据条目的P值筛选出相关性较高的信号通路;依托Chem 3D、AutoDock、Pymol等软件对核心成分和关键靶点进行分子对接,在分子层面进一步阐明血必净注射液治疗脓毒症的具体机制.结果 筛选并获得113个血必净注射液治疗脓毒症的潜在作用靶点.PPI网络分析依据degree值筛选出排名前5的核心靶点,分别是白细胞介素(IL)-1β、IL-6、蛋白激酶B(AKT)1型、肿瘤抑制蛋白(TP53)、血管内皮生长因子A(VEGFA).GO和KEGG富集分析显示血必净注射液在脓毒症治疗中涉及多条信号通路,主要包括IL-17、肿瘤坏死因子(TNF)、缺氧诱导因子(HIF)-1信号通路及Th17细胞的分化等,其中IL-17信号通路高度富集.通过分子对接,发现血必净注射液中排名前3的核心成分槲皮素、山奈酚、木樨草素与IL-1β、IL-6和TP53的对接结合能均小于-5 kcal/mol,说明槲皮素、山奈酚和木樨草素能够较好地与核心靶点结合,具有较好的结合能力.结论 血必净注射液具有"多成分、多靶点、多途径"的功效.槲皮素、山奈酚和木樨草素可能是血必净注射液的主要活性成分,IL-1β、IL-6和TP53蛋白可能是血必净注射液治疗脓毒症的潜在治疗靶点.血必净注射液可能通过IL-17、TNF、HIF-1信号通路和Th17细胞的分化等途径发挥治疗作用.

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作者: 陈秋华 [1] 庄燕 [1] 蒋华 [1] 张海东 [1] 戴林峰 [1]
分类号: R735.3
栏目名称: 基础研究
DOI: 10.3969/j.issn.2096-3882.2024.06.005
发布时间: 2024-07-30
基金项目:
国家自然科学基金 江苏省中医药管理局科技发展计划项目 江苏省中医院科主任提升专项课题 江苏省中医院院级课题
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