换一批
换一批自转录活性调节区测序技术在增强子发现研究中的应用
Principle and application of self-transcribing active regulatory region sequencing in enhancer discovery research
摘要：
自转录活性调节区测序(self-transcribing active regulatory region sequencing,STARR-seq)是一种可发现并同时验证全基因组增强子活性的高通量测序方法.其原理为:将待验证序列插入质粒载体并电转入细胞中,该序列在作为增强子提高靶基因转录的同时,其本身也作为靶基因被增强转录.通过对转录组进行测序,并对比未插入片段的测序结果,可获得增强子在基因组位置及活性的信息.在传统增强子研究方法中,通过对染色质开放区域和转录活性区域进行测序以预测增强子,但只能逐一验证预测结果,无法高通量验证增强子活性.STARR-seq技术解决了上述缺陷,可在对全基因组增强子高通量挖掘的同时,对其活性进行可靠的验证.自STARR-seq技术发明以来,已被广泛运用于不同物种与细胞中的增强子发现及活性验证研究.本文对传统增强子预测方法以及STARR-seq技术的基本原理、发展历史和具体运用进行了介绍,并对其发展前景进行展望,以期为后续增强子相关领域研究人员提供参考.
更多
作者：
作者单位：
广西医科大学寄生虫学教研室,南宁 530021
[1]
广西医科大学细胞生物学教研室,南宁 530021;广西高校区域性疾病基础研究重点实验室(广西医科大学),南宁 530021
[2]
广西医科大学寄生虫学教研室,南宁 530021;广西高校区域性疾病基础研究重点实验室(广西医科大学),南宁 530021
[3]
期刊：
《遗传》2024年46卷8期 589-602页
MEDLINEISTICPKUCSCDBP
关键词：
自转录活性区域测序增强子转录调控单核苷酸多态性STARR-seqenhancertranscriptional regulationsingle nucleotide polymorphism
栏目名称：
综述
DOI：
10.16288/j.yczz.24-149
发布时间：
2024-09-02
- 浏览：0
- 被引：0
- 下载：0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
