换一批
换一批基于GEO数据库的慢性自发性荨麻疹基因集富集及免疫细胞浸润分析
Bioinformatics-based gene set enrichment and immune cell infiltration analysis of chronic spontaneous urticaria based on GEO database
摘要：
目的:基于基因表达数据库(GEO)对慢性自发性荨麻疹(CSU)表达谱芯片数据筛选差异表达基因并进行基因集富集分析(GSEA)和免疫细胞浸润分析,深入了解CSU的发病机制.方法:从GEO数据库中获取GSE72541芯片数据,利用R软件获取差异表达基因并构建蛋白质相互作用(PPI)网络;利用GSEA软件进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;利用ssGSEA方法对表达谱进行免疫细胞浸润分析.结果:与血小板活化及其功能密切相关的基因在CSU血清中上调,与Th1细胞趋化相关的基因在CSU血清中下调;与凝血级联反应、血管通透性的调节、免疫及炎症反应以及神经精神的调控等方面相关的生物过程及信号通路在CSU组上调;免疫细胞浸润分析显示活化的B细胞、未成熟B细胞、滤泡辅助性T细胞以及Th2细胞在CSU组显著下调.结论:血小板活化、凝血级联反应与Th1/Th2免疫细胞失衡在CSU的发病中有重要意义.
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作者：
作者单位：
北京中医药大学东直门医院,北京 100700
[1]
期刊：
《中国免疫学杂志》2024年40卷7期 1405-1410,中插1页
ISTICPKUCSCD
关键词：
慢性自发性荨麻疹基因集富集分析免疫细胞浸润凝血级联反应自身免疫Th1/Th2细胞Chronic spontaneous urticariaGene set enrichment analysisImmune cell infiltrationCoagulation cascade reac-tionAutoimmunityTh1/Th2 cells
分类号：
R758.24
栏目名称：
论著/基础免疫学
DOI：
10.3969/j.issn.1000-484X.2024.07.010
发布时间：
2024-08-05
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