马尔尼菲篮状菌磷脂酶A基因家族鉴定与表达
Identification and expression of the phospholipase A gene family in Talaromyces marneffei
目的 对马尔尼菲篮状菌(Talaromyces marneffei)磷脂酶A(phospholipase A,PLA)基因家族进行鉴定分析,为进一步研究马尔尼菲篮状菌PLA潜在致病作用和机制奠定基础.方法 利用生物信息学方法对马尔尼菲篮状菌PLA基因家族成员进行全基因组鉴定,分析其基因结构、染色体定位、蛋白理化性质和结构、保守基序及系统进化关系,并利用实时定量反转录聚合酶链式反应(real-time quantitative reverse transcription polymerase chain reaction,qRT-PCR)方法分析PLA基因在该菌侵染巨噬细胞时的表达水平.结果 从马尔尼菲篮状菌基因组中鉴定到 8个PLA,不均匀分布在5条染色体上,不存在串联重复和片段复制现象.PLA家族氨基酸数目为577~1 546个,相对分子质量为65 120~170 690,等电点为4.47~9.28,均为亲水蛋白,除PLA3外的其余PLA成员属于不稳定蛋白.系统进化分析表明马尔尼菲篮状菌PLA可分为PLA2和patatin-like磷脂酶2个亚族,成员数量分别为3和5.同一亚族基因结构、蛋白保守基序和结构较为相似,但不同亚族之间具有明显差异.qRT-PCR结果表明,马尔尼菲篮状菌侵染小鼠巨噬细胞时PLA3、PLA6和PLA8表达上调.结论 PLA3、PLA6和PLA8可能与马尔尼菲篮状菌能够在巨噬细胞内生存繁殖有关.
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