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一起副溶血性弧菌食物中毒事件中菌株全基因组测序与耐药性分析

Whole genome sequencing and antibiotic resistance analysis of Vibrio parahaemolyticus isolated from a food poisoning incidents

摘要:

目的 对2023年淮安市一起食物中毒事件分离的副溶血性弧菌进行全基因组测序和耐药性分析,为副溶血性弧菌引起的食源性疾病的防控和临床治疗提供参考.方法 采用Illumina测序平台进行全基因组测序,通过全基因组单核苷酸多态性(wg-SNP)和多位点序列分型(MLST)分析进行溯源,在线数据库鉴定菌株携带的毒力和耐药基因,采用微量肉汤稀释法进行药敏实验.结果 共分离到12株副溶血性弧菌,3株来自病例、9株来自留样食品.其中2株食物分离株与3株病例分离株wg-SNP差异数为0~2bp,都属于ST3型,判断为同一克隆;其余7株食物分离株与病例分离株wg-SNP差异数为11 341~37 173 bp,判定为不同克隆.从病例和食品中分离的ST3型副溶血性弧菌都携带外毒素基因tdh和tlh,其余菌株仅携带tlh.本事件分离的副溶血性弧菌都携带blaCARB型耐药基因,且对头孢唑啉耐药率较高.结论 通过全基因组测序分析,本起事件由携带tdh毒力基因的ST3型副溶血性弧菌污染食品引发,显示全基因组测序技术在中毒事件快速溯源中有较好的应用前景.该菌株对头孢唑啉耐药,可为临床治疗抗生素选用提供依据.

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作者: 李兵兵 [1] 张茹 [2] 刘靓 [1] 李洁 [1] 陈大伟 [1] 李双姝 [1] 杨鹏飞 [1] 刘纯成 [1] 邢亚东 [1]
期刊: 《中国食品卫生杂志》2024年36卷5期 528-532页 ISTICPKUCSCD
分类号: R155
栏目名称: 研究报告
DOI: 10.13590/j.cjfh.2024.05.003
发布时间: 2024-09-09
基金项目:
淮安市创新能力建设计划 江苏省预防医学科研课题
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