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利用转录组测序技术在大连地区发现类鼻疽伯克霍尔德菌感染病例

Burkholderia pseudomallei infection case was found in Dalian by transcriptome sequencing

摘要:

目的 利用转录组测序技术直接检测疑似感染患者标本中的未知病原体,为感染的诊断、治疗和预警提供依据.方法 对大连地区疑似感染的一名患者的标本进行RNA提取,直接用于RNA文库构建和测序,对测序获得数据进行生物信息学分析,与微生物数据库进行比对.为验证可疑病原体,对标本进行分离培养和特异性PCR扩增.结果 经分析,该患者标本有2 216条序列reads与类鼻疽伯克霍尔德菌同源,验证结果显示从标本中分离到鼻疽/类鼻疽伯克霍尔德菌,并从标本中特异扩增出类鼻疽伯克霍尔德菌的序列而未扩增出鼻疽伯克霍尔德菌的序列,提示患者体内存在类鼻疽伯克霍尔德菌感染.结论 首次在大连地区检出类鼻疽病例.转录组测序技术可直接检测疑似感染患者体内未知病原体,可为传染病等突发公共卫生事件的预警、监测和处置提供有力手段.

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作者: 栾明春 [1] 王越 [1] 郎兴莹 [1] 薄志坚 [1]
期刊: 《中国微生态学杂志》2024年36卷7期 813-816页 ISTICCSCD
分类号: R372
栏目名称: 临床研究
DOI: 10.13381/j.cnki.cjm.202407011
发布时间: 2024-09-03
基金项目:
大连市科技创新基金项目
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