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甘草鲨烯环氧酶基因家族成员鉴定及其非生物胁迫下的表达分析
编辑人员丨6天前
甘草酸(glycyrrhizic acid)是甘草(glycyrrhiza)中重要活性成分之一,具有护肝和抗病毒等功效.鲨烯环氧酶(squalene epoxidase,SQE)是甘草酸合成途径中的重要酶.目前,系统分析甘草中SQE基因家族及其功能的研究较少.本研究通过对甘草SQE基因家族生物信息学、表达特异性及与甘草酸含量相关分析,了解SQE基因家族在甘草酸合成中的作用.结果显示:3种药用甘草共有11个SQE基因,其中光果甘草(Glycyrrhiza glabra)和胀果甘草(Glycyrrhiza inflata)均有4个,乌拉尔甘草(Glycyrrhiza uralensis)有3个,同源性高的SQE基因具有相似的表达特性且染色体上处于相似位点;不同的SQE基因呈现不同的表达特性;GgSQE1、GiSQE1、GuSQE1和GuSQE3主要在根部表达,GgSQE3在甘草全株高表达;在苗期不同种类的甘草受15%PEG6000和150 mmol/L NaCl处理不同时间点下,GgSQE1、GgSQE3、GiSQE1、GiSQE3和GuSQE1表达量变化与甘草酸含量变化具有相似的趋势;进一步分析发现,上述基因的启动子区含有较多的逆境胁迫响应元件,推测SQE1和SQE3可能在甘草受非生物胁迫后参与甘草酸的合成.本研究的结果为下一步高甘草酸含量的育种研究提供候选基因,为深入了解非生物胁迫提升甘草酸含量的分子机制研究提供研究基础.
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编辑人员丨6天前
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屎肠球菌F11.1G比较基因组、代谢组学分析及代谢产物挖掘
编辑人员丨6天前
[背景]屎肠球菌(Enterococcus faecium)具有抑制常见致病菌的作用,在禁抗的大环境下,逐渐成为常规抗生素生长促进剂的有效替代品.但随着屎肠球菌应用范围的扩大,其安全性问题日益受到关注.[目的]从基因水平阐明其细菌素编码基因簇,评估其安全性并探究屎肠球菌F11.1G基因功能和潜在代谢产物,代谢组学分析菌株胞内外的代谢物差异,并对其活性代谢产物进行挖掘.[方法]全基因组测序对其基因信息进行注释和功能预测,采用功能基因组和比较基因组方法,分析菌株F11.1G的益生性和安全性特征,揭示其与益生屎肠球菌T110之间的差异,代谢组学对菌株中的代谢物进行鉴定,随后通过结构鉴定挖掘出活性代谢产物.[结果]菌株F11.1G注释到4个毒力相关基因和3个耐药基因,antiSMASH数据库预测到了 3种次级代谢产物基因簇;比较基因组分析结果表明,菌株F11.1G与菌株T110具有较高相似性,菌株T110未预测到毒力基因、耐药基因和病原菌基因.非靶向代谢组学结果表明,胞内外差异代谢产物主要集中在萜类和聚酮类、氨基酸、有机杂环化合物等,可能与菌株F11.1G的抑菌作用相关.从菌株F11.1G的活性代谢产物分离鉴定出α-D-型葡萄糖、4-氧化戊酸、毛蕊花糖、水苏糖、二聚体白屈菜默碱、1-羟基蒽醌和极少量酮类活性物质.[结论]菌株F11.1G具有合成抗生素或新型次级代谢产物的潜力,但还携带毒力因子和毒力基因,后期可通过分离纯化肠球菌素发挥其益生菌特性.
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编辑人员丨6天前
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PET/CT、SPECT/CT影像组学:沟通宏观影像和微观分子的桥梁
编辑人员丨6天前
PET/CT、SPECT/CT作为典型的多模态成像方式,既能反映病灶的解剖形态学信息,又能反映细胞分子水平的功能信息,为临床肿瘤、心血管疾病等的诊断、疗效监测和预后评估提供了重要参考依据。目前,基于PET/CT影像的疾病诊断主要依靠大小、形态、位置、密度等形态学征象以及SUV、肿瘤代谢体积(metabolic tumor volume, MTV)和病灶糖酵解总量(total lesion glycolysis, TLG)等半定量功能参数进行判断。然而,这些指标无法定量评估病灶的结构及代谢异质性,难以量化疾病的微观结构及代谢改变。近年来,随着人工智能算法的不断发展,新的模式识别技术和图像处理技术不断涌现,影像组学应运而生,并快速应用于PET/CT、SPECT/CT影像的量化分析中 [ 1, 2] 。影像组学基于医学图像中的定量影像特征可描述不同疾病的生物学特性这一假设,利用人工智能方法从PET/CT、SPECT/CT等影像中高通量地挖掘并分析更多客观定量、肉眼难以识别的特征参数,打通宏观影像信息和微观病理分子信息的关联,从而为临床疾病的无创诊疗辅助决策提供量化依据。
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编辑人员丨6天前
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痘苗病毒天坛广-9分离株的生物学特性初步研究
编辑人员丨6天前
目的:进一步研究痘苗病毒天坛株(vaccinia virus Tiantan strain, VTT)中传代获得的广-9株(VG9)的生物学特性。方法:取冻干VG9株复溶后接种Vero细胞进行复苏并连续传代,通过间接免疫荧光法和PCR法对该毒株进行鉴定。使用二代测序技术对该毒株进行全基因组测序,将测序结果与天坛株参考基因组序列及其他33株正痘病毒基因组序列进行比对,并绘制系统发育树。通过终末稀释法获得1株VG9克隆纯化株(VG9-V3-3),对该克隆株的病毒滴度、兔皮内毒力等生物学特性进行初步研究。结果:经间接免疫荧光鉴定,VG9株可以与VTT兔免疫血清特异性结合,PCR结果证明该病毒株含有痘苗病毒特征性TK基因片段。全基因组测序结果显示该VG9株基因组全长183 596 bp,其中编码区165 150 bp,将测序结果在NCBI核心核苷酸数据库内进行比对,结果显示VG9株与现有多个VTT株的序列高度同源(一致性>99.5%)。经序列比对发现VG9株与VTT TP5分离株的基因序列共存在749个核苷酸位点差异。VG9-V3-3分离株的病毒滴度为6.3 lg (PFU/ml),兔皮内毒力试验显示其毒力较VTT株明显减弱。结论:对VG9株生物学特性进行了初步研究并获得1株纯化克隆株VG9-V3-3,该分离株病毒滴度基本稳定,且毒力较VTT株明显减弱,后续还将对该毒株的免疫原性进行深入研究,以探索其作为疫苗生产毒株的可行性。
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编辑人员丨6天前
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图像配准方法在乳腺癌瘤床靶区勾画中的应用进展
编辑人员丨6天前
乳腺癌保乳术后放疗方案中,瘤床及其靶区的准确勾画至关重要。利用不同医学图像与放疗定位CT图像进行配准能提供更加全面的信息从而辅助医生勾画靶区。根据几何变换性质可将图像配准方法分为刚性和非刚性两大类。由于软组织易形变的特性,刚性配准较难实现非刚性结构的严格匹配,非刚性配准的结果更加符合复杂形变的实际情况。文章旨在综述两类配准方法在乳腺癌瘤床靶区勾画中的应用,分析临床应用中存在的问题,并展望非刚性配准未来的研究方向。
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编辑人员丨6天前
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微小RNA-590-3p靶向叉头框蛋白A2对肿瘤细胞增殖和转移特性的影响
编辑人员丨6天前
目的:探讨微小RNA(miRNA,miR)-590-3p靶向叉头框蛋白A2(FOXA2)对肿瘤细胞增殖和转移特性的影响。方法:采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析人卵巢上皮细胞HOSEpiC和卵巢癌细胞skov3中miR-590-3p水平;将人浆液性卵巢癌细胞系skov3随机分为对照组和观察组,分别采用miRNA对照和miR-590-3p抑制剂转染skov3细胞,72 h后采用细胞计数试剂盒(CCK-8)、克隆形成实验和体外移植瘤实验分析两组细胞的增殖能力;采用Transwell和蛋白质印迹法(Western blot)分析两组细胞迁移、侵袭和上皮间质转化能力;采用生物信息学和双荧光素酶报告基因分析miR-590-3p的靶基因,Western blot分析两组细胞靶基因表达以及增殖和迁移相关蛋白表达水平。计量数据比较采用 t检验。 结果:人卵巢上皮细胞HOSEpiC miR-590-3p表达水平(0.77±0.14)明显低于卵巢癌细胞skov3 miR-590-3p表达水平(1.22±0.15),差异有统计学意义( t=5.450, P<0.05)。对照组细胞48 h吸光度值(2.06±0.13)明显高于观察组(1.37±0.12),差异有统计学意义( t=9.279, P<0.05)。对照组细胞克隆形成数量[(125.83±12.19)个]明显高于观察组[(103.67±10.04)个],差异有统计学意义( t=3.169, P<0.05)。对照组细胞肿瘤体积[(976.68±79.77) mm 3]明显高于观察组[(718.60±52.52) mm 3],差异有统计学意义( t=6.619, P<0.05)。对照组细胞肿瘤肿瘤[(4.42±0.51) g]明显高于观察组[(2.74±0.33) g],差异有统计学意义( t=6.807, P<0.05)。对照组细胞迁移数量[(134.50±9.89)个]明显高于观察组[(108.17±7.63)个],差异有统计学意义( t=5.163, P<0.05)。对照组细胞侵袭数量[(93.83±5.31)个]明显高于观察组[(73.29±5.21)个],差异有统计学意义( t=6.414, P<0.05)。对照组细胞上皮细胞标志物E-钙黏蛋白(E-cadherin)表达水平(0.67±0.13)明显低于观察组(1.25±0.12),差异有统计学意义( t=7.763, P<0.05)。对照组细胞间质细胞标志物β-连环蛋白(β-catenin)和N-钙黏蛋白(N-cadherin)表达水平(1.25±0.12、1.22±0.13)明显高于观察组(0.92±0.06、0.69±0.07),差异有统计学意义( t=6.091、8.993, P<0.05)。FOXA2是miR-590-3p的靶基因。对照组细胞FOXA2蛋白表达水平(1.21±0.13)明显低于观察组(2.16±0.14),差异有统计学意义( t=12.200, P<0.05)。 结论:miR-590-3p沉默可显著促进靶蛋白FOXA2表达,抑制卵巢癌细胞增殖和转移能力。
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编辑人员丨6天前
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5G赋能全流程医疗服务链及其关键支持要素探讨
编辑人员丨6天前
具有高速率、低时延、广连接等特性的5G技术,可优化"诊前、诊中、诊后"全流程医疗服务链,提升医疗服务效率。作者指出5G赋能可优化居家健康监测、院前急救等诊前服务,也可优化远程诊断、远程会诊、远程超声、远程手术等诊中服务,还可优化院内医疗监测、移动医护、智慧送药、无接触式服务等诊后服务。5G赋能全流程医疗服务链感知有用性与易用性的提高需要若干关键要素的支持,包括5G医疗服务多元技术融合、5G技术本身与相关技术的完善、5G医疗服务标准化的持续推进等。只有促进信息技术与医疗服务的深度融合,为患者提供覆盖诊前、诊中、诊后的全流程、智能化服务,才能进一步提升患者就医体验。
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编辑人员丨6天前
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基于医学专业特性对线上教学督导的分析与研究
编辑人员丨6天前
鉴于医学专业的系统性、严谨性、实践性等学科特性,如何保证线上课程的教学质量备受关注,在传统授课模式中,教学督导是保障教学质量的重要方法,因此将教学督导工作引入线上教学活动具有重要意义。本文对国内外医学线上课程的开展经验进行系统性回顾与总结,从督导含义、线上督导工作的必要性、线上督导方式、技术手段、督导信息的反馈和应用,以及标准化线上督导流程建设等维度展开分析,对线上医学课程的教学督导进行探索与研究。
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编辑人员丨6天前
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前列腺癌肿瘤相关成纤维细胞的研究进展与临床价值
编辑人员丨6天前
前列腺癌是男性泌尿生殖系统最常见的恶性肿瘤之一,严重威胁着男性生命健康。前列腺癌发生转移或去势抵抗不仅取决于癌细胞自身,也取决于癌细胞所处的肿瘤微环境。肿瘤相关成纤维细胞是前列腺癌肿瘤微环境中的重要组成部分,在调节肿瘤增殖、转移、代谢和免疫逃逸等方面发挥多重作用。近年来单细胞转录组学、空间转录组学及代谢组学等多组学技术深入阐明肿瘤相关成纤维细胞(CAFs)的特征及其在前列腺癌促癌抑癌作用中的调节机制,这让我们进一步了解到CAFs与前列腺癌细胞间信息交流。本文就CAFs的生物学特性及其在前列腺癌中的研究进展与临床价值作一综述,为前列腺癌的临床治疗提供新思路。
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编辑人员丨6天前
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CRKL对肺癌细胞增殖和转移的影响及其上游调控因子研究
编辑人员丨6天前
目的:探讨CRKL对肺癌细胞增殖和转移的影响及其上游调控因子筛选。方法:选取2022年12月至2024年6月河南省人民医院收治49例肺癌组织和癌旁组织作为研究对象,采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)和蛋白质免疫印迹分析肺癌组织和癌旁组织CRKL mRNA和蛋白质表达水平。人非小细胞肺癌H1299细胞分为对照短发卡RNA(shRNA)组和CRKL shRNA组,采用对照shRNA和CRKL shRNA慢病毒感染细胞,建立稳定细胞系,采用细胞计数试剂盒(CCK-8)和克隆形成实验分析两组细胞增殖能力;采用划痕实验和Transwell分析两组细胞的迁移和侵袭能力;采用蛋白质免疫印迹分析两组细胞的上皮间质转化能力;采用生物信息学筛选调节CRKL表达的微小RNA(miRNA,miR),并采用双荧光素酶报告基因进行验证。组间比较采用 t检验。 结果:癌旁组织CRKL mRNA和蛋白质表达水平(0.93±0.13、0.71±0.19)低于肺癌组织(1.64±0.21、1.28±0.32),差异有统计学意义( t=20.230、10.560, P<0.05)。对照shRNA组CCK-8吸光度值和克隆形成率[1.86±0.06、(60.26±6.29)%]高于CRKL shRNA组[1.38±0.11、(36.50±5.49)%],差异有统计学意义( t=10.110、7.528, P<0.05)。对照shRNA组细胞划痕愈合率和侵袭细胞数量[(76.79±9.23)%、(129.11±17.99)个]高于CRKL shRNA组[(57.07±7.82)%、(86.11±10.95)个],差异有统计学意义( t=4.314、5.400, P<0.05)。对照shRNA组细胞上皮标志物E-钙黏蛋白(E-cadherin)表达水平(0.90±0.08)高于CRKL shRNA组(0.38±0.14),差异有统计学意义( t=8.347, P<0.05)。对照shRNA组细胞间质标志物N-钙黏蛋白(N-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)以及转录因子Slug表达水平(0.72±0.11、0.62±0.11、0.66±0.20)低于CRKL shRNA组(1.30±0.21、1.30±0.23、1.10±0.16),差异有统计学意义( t=6.549、7.061、4.577, P<0.05)。miR-445-5p是调节CRKL表达的主要调节分子。癌旁组织miR-455-5p表达水平(1.05±0.11)高于肺癌组织(0.58±0.19),差异有统计学意义( t=14.510, P<0.05)。 结论:CRKL在肺癌组织中表达水平显著增加,促进肺癌细胞的增殖和转移等恶性细胞生物学特性,其表达受到miR-455-5p调节。
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编辑人员丨6天前
