目的:探讨宏基因组高通量测序（mNGS）所揭示的感染谱特征，为异基因造血干细胞移植（allo-HSCT）后感染诊断提供参考。方法:选取2018年1月至11月河北燕达陆道培医院行allo-HSCT后出现全身或局部感染症状的血液病患者64例。用mNGS方法检测血液、脑脊液、肺泡灌洗液等标本中存在的所有病原微生物基因序列，并结合患者的临床表现确定致病或疑似致病的病原体。结果:共对64例allo-HSCT患者进行了97份样本的mNGS检测。革兰阳性菌中最常见为溶血葡萄球菌（19例次）和人葡萄球菌（14例次），革兰阴性菌中最常见为鲍曼不动杆菌（8例次）；病毒中最常见的为巨细胞病毒、EB病毒和细环病毒（分别为35、22和23例次）；真菌中最常见的为球形马拉色菌（14例次）和近平滑念珠菌（8例次）。3例检测到结核分枝杆菌复合群，均见于急性髓系白血病移植后患者。1例患者痰液中检测到口腔支原体，寄生虫未见。结论:mNGS可全面揭示血液病allo-HSCT后的感染谱，尤其对于少见和难培养病原微生物检测具有显著优势，可有效帮助临床感染病原体的诊断。

目的:建立猪带绦虫（Ts）14-3-3.2原核表达系统，并观察Ts14-3-3.2蛋白在Ts成虫和囊尾蚴中的表达情况。方法:在遵义医科大学寄生虫学教研室前期获得Ts14-3-3.2基因序列的基础上，采用基于PCR的精确合成（PAS）方法全基因合成Ts14-3-3.2基因，经限制性内切酶 NdeⅠ和 XbaⅠ双酶切后连接质粒pCzn1，构建重组质粒pCzn1-Ts14-3-3.2。将重组质粒转化至大肠埃希菌ArcticExpress感受态细胞中诱导表达，采用十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）和考马斯亮蓝染色分析和鉴定表达产物，通过镍（Ni）柱亲和纯化获得纯化Ts14-3-3.2重组蛋白。采用该纯化重组蛋白免疫新西兰大白兔，制备Ts14-3-3.2重组蛋白多克隆抗体，采用免疫印迹法（Western blot）检测Ts14-3-3.2蛋白在Ts成虫和囊尾蚴中的表达情况。 结果:成功构建重组质粒pCzn1-Ts14-3-3.2，诱导表达后菌体上清液和沉淀均在相对分子质量约29.31 × 10 3处出现Ts14-3-3.2目的蛋白条带。纯化后带有His标签的Ts14-3-3.2重组蛋白能被抗His单克隆抗体识别，获得效价为1∶512 000的Ts14-3-3.2重组蛋白多克隆抗体。Western blot结果显示，Ts14-3-3.2蛋白在Ts成虫和囊尾蚴中均有表达。 结论:成功建立Ts14-3-3.2原核表达系统，获得了高纯度、高效价的Ts14-3-3.2重组蛋白多克隆抗体。Ts14-3-3.2蛋白在Ts成虫和囊尾蚴阶段均有表达。

片形吸虫病是一种人畜共患寄生虫病，人类感染较为罕见。因其临床表现不具有特异性、发病率低且诊断困难易被误诊，导致治疗延误及不必要的手术干预。临床诊断需血清学检测提示抗片形吸虫IgG抗体阳性，确诊通常根据粪便或十二指肠引流液检查见片形吸虫虫卵或者病理切片检查见片形吸虫虫体。现报道1例由宏基因组高通量测序技术诊断的急性片形吸虫感染患者，以期为该病的诊断提供新思路。

宏基因组下一代基因测序（mNGS）能够无偏倚分析患者样本中全部微生物和宿主基因含量，被越来越多地用于诊断罕见、复杂和严重感染性疾病。此外，mNGS在病原体亚型分类、耐药性、毒力分析以及病原体与宿主发育相关性等方面也有广阔的应用前景。因感染人类免疫缺陷病毒（HIV）所致患者因免疫缺陷诱发的眼部机会性感染会严重破坏眼部组织结构和功能，是危及视力，导致患者失明的重要原因。HIV眼病的致病微生物包含细菌、病毒、真菌、螺旋体或寄生虫等。HIV患者机会性感染临床症状和体征多变，甚至存在混合感染，难以鉴别，而传统病原学检测由于眼球体积小、眼内液细胞含量少而取样困难，且特异性差，故应用受限。mNGS相比传统检测方法，可以小样本、快速、准确识别眼内感染的全部病原体并对病原体毒力、耐药性等做出分析。笔者将按病原体分类介绍mNGS在对并发眼内机会性感染的HIV患者进行无偏倚微生物检测分析中的应用。

目的:了解山东省烟台市人体重点寄生虫的感染状况，为制定防治策略和措施提供科学依据。方法:根据《全国人体重点寄生虫病现状调查方案》和实施细则，于2015 - 2019年采取分层整群随机抽样方法，从烟台市抽取10个县（市、区）的39个自然村作为调查点。调查对象为各调查点居民，每个调查点人数不少于200人。采用改良加藤厚涂片法（一粪二检）检测肠道蠕虫虫卵；直接涂片法检测肠道原虫滋养体或包囊；3 ~ 9岁儿童加做透明胶纸肛拭法检测蛲虫。采用SPSS 18.0软件进行统计分析，组间感染率比较采用χ 2检验或Fisher确切概率法，检验水准α = 0.05。 结果:2015 - 2019年共调查8 507人，肠道寄生虫总感染率为1.75%（149/8 507），未检出原虫，共检出4种肠道蠕虫，分别为鞭虫（1.41%，120/8 507）、蛔虫（0.16%，14/ 8 507）、蛲虫（0.14%，12/8 507）、钩虫（0.07%，6/8 507）。149例蠕虫感染者中，混合感染者3例，占2.01%，均为鞭蛔混合感染。透明胶纸肛拭法检测儿童578名，儿童蛲虫感染率为1.90%（11/578）。2015 - 2019年肠道寄生虫感染率先上升后下降，不同年份间比较，差异有统计学意义（χ 2 = 469.38， P < 0.05）。男性、女性的感染率分别为1.72%（70/4 071）、1.78%（79/4 436），二者比较差异无统计学意义（χ 2 = 0.05， P > 0.05）。不同年龄组人群肠道寄生虫感染率比较，差异有统计学意义（χ 2 = 23.34， P < 0.05）；其中≥80岁组最高，为2.84%（8/282）。不同职业者肠道寄生虫感染率比较，差异有统计学意义（χ 2 = 41.71， P < 0.05）；其中农民感染率最高，为2.58%（113/ 4 388）。不同文化程度者肠道寄生虫感染率比较，差异有统计学意义（χ 2 = 51.91， P < 0.05）；其中文盲感染率最高，为4.98%（16/321）。10个县（市、区）中除莱山区外，均检出寄生虫感染，感染率最高的为海阳市（10.18%，102/1 002），其余县（市、区）均低于1.20%；不同地区感染率比较，差异有统计学意义（χ 2 = 433.87， P < 0.05）。城区感染率为0.51%（22/4 281），乡村感染率为3.01%（127/4 226），二者比较差异有统计学意义（χ 2 = 76.70， P < 0.05）。 结论:烟台市乡村地区肠道寄生虫感染率已降至较低水平，但农民仍为肠道寄生虫感染重点防治人群，应引起重视，加大寄生虫病防控的宣传力度。

本例患者长期居住于美国马萨诸塞州，急性起病，抵达中国后因发热伴贫血、黄疸就诊，血宏基因组学二代测序(mNGS)检测出田鼠巴贝虫，外周血涂片示部分红细胞内见寄生虫，确诊为人田鼠巴贝虫病，予米诺环素联合克林霉素抗感染治疗后病情好转。提示入境患者出现不明原因发热时，需了解当地流行病学特征，可选择mNGS进行病原学检测。此外，米诺环素是否可作为治疗巴贝虫病的备选药物尚需进一步探索。

目的:探讨宏基因二代测序技术对感染性脑炎与脑膜炎病原体诊断的临床价值。方法:回顾性分析2018年3月至2019年9月于赤峰学院附属医院神经内科住院诊断为感染性脑炎与脑膜炎患者的临床特点、二代测序与传统实验室检测病原体的相关资料。结果:104例颅内感染的脑脊液样本检出以下致病病原体DNA特异性序列：细菌22例（22/104，21.15%）、病毒24例（24/104，23.08%）、真菌1例（1/104，0.96%）、寄生虫1例（1/104，0.96%）、支原体1例（1/104，0.96%）， 其中检测出最多的3种病原体为水痘-带状疱疹病毒、链球菌和结核分枝杆菌。通过宏基因二代测序技术诊断的真阳性结果例数为49例，真阳性率为47.12%（49/104），假阳性结果例数为21例，假阳性率20.19%（21/104），假阴性结果例数为34例，假阴性率32.69%（34/104）。结论:宏基因二代测序技术对感染性脑炎与脑膜炎的病原体检测较传统的病原学检测方法更敏感，在感染性脑炎与脑膜炎的精准化诊断方面具有优势。

本文报道1例以反复肺出血为表现的血管型Ehlers-Danlos综合征。患者男，22岁，因“间断咯血、胸痛18个月”入院。胸部CT示双肺多发结节及空洞，周围伴晕征。血清炎症指标包括血沉、C反应蛋白、白介素-6均在正常范围，经多次支气管镜、肺活检病原及病理学检查未能明确诊断，曾给予经验性抗细菌、抗真菌、抗结核、抗寄生虫治疗，肺内病变仍表现出此消彼长的特点。胸腔镜肺活检病理见肺出血、血肿、骨化及纤维性结节，提示血管型Ehlers-Danlos综合征的可能性。最终经基因检测发现COL3A1突变，诊断为血管型Ehlers-Danlos综合征。该患者无皮肤松弛、关节过伸等肺外表现。随诊3年，患者除间断有少量咯血外，尚未出现其他血管或脏器受累证据。对于以反复咯血为表现，肺内表现为此消彼长的结节、空洞或囊腔而无明显炎症反应、对抗感染治疗无效的年轻患者，应考虑到血管型Ehlers-Danlos综合征的可能性，尽早进行基因检测，避免不必要的有创检查对患者的伤害。

目的:了解南昌市土源性线虫病国家监测点病情监测结果，以科学制订南昌市寄生虫病防治策略。方法:2016 - 2020年在南昌市南昌县土源性线虫病国家监测点，每年调查不少于1 000人份3周岁以上常住居民的粪便样本和25份土壤样本，采用改良加藤厚涂片法检测人群土源性线虫虫卵，试管滤纸培养法进行钩虫虫种鉴定，透明胶纸肛拭法检测3 ~ 9周岁儿童蛲虫卵，并对土壤样本进行钩蚴和人蛔虫卵鉴定。结果:南昌市土源性线虫病国家监测点2016 - 2020年土源性线虫总感染率为0.93%（47/5 054），各年感染率分别为0.10%（1/1 000）、2.94%（30/1 021）、0.79%（8/1 008）、0.50%（5/1 002）和0.29%（3/1 023），钩虫、蛔虫和鞭虫感染率分别为0.42%（21/5 054）、0.02%（1/5 054）和0.49%（25/5 054），轻度感染者占97.87%（46/47）。人群分布特征显示，不同文化程度间土源性线虫感染率比较差异有统计学意义（χ 2 = 18.06， P = 0.001），不同性别、年龄、职业间感染率比较差异均无统计学意义（χ 2 = 0.92、2.01、13.60，均 P > 0.05），其中初中文化人群感染率最高（1.84%，24/1 301）。钩蚴培养显示，美洲钩虫占90.48%（19/21）；3 ~ 9周岁儿童蛲虫感染率、土壤钩蚴和人蛔虫卵污染率均为0。 结论:南昌市土源性线虫病国家监测点病情呈低度流行趋势，鞭虫和钩虫是今后南昌市重点关注土源性线虫虫种。

病原体(pathogen)是指能导致人、动物等生物发生感染的媒介统称，主要包括微生物和寄生虫。微生物占绝大多数，包括病毒、细菌、衣原体、立克次体、支原体、螺旋体和真菌，广泛存在于人体呼吸系统、消化系统、生殖系统等组织中，通常情况下在体内达到平衡状态，一般不会发病。随着人类生活方式和环境的变化，如果某一种病原体突然增多或大量繁殖，或人体免疫力下降体内系统平衡遭到破坏，即可导致疾病。如果引起这些疾病的病原体相对"罕见"，意味着其相关基础研究较少，缺乏相应的检测项目，临床医生很难根据症状判断感染原，因此快速、精准找到病原体，显得尤为重要。本刊特邀广州中医药大学第二临床医学院/广东省中医院屈平华教授担任本期"罕见病原体"重点号执行编委，对近几年临床分离的罕见病原体进行论述和总结，希望为我国的临床医学研究提供有力的诊疗依据及理论支撑。