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目的 探索可以特异性识别高转移胃癌细胞(HGC-27)的核酸适配体LW-25的靶标蛋白.方法 合成已知的可以特异性识别HGC-27而不识别无转移能力的胃腺癌细胞的LW-25.首先,通过胰蛋白酶消化细胞来确定核酸适配体结合的靶标类型是蛋白质,然后通过裂解细胞提取出蛋白质.用核酸适配体介导的亲和富集实验富集出LW-25所结合的蛋白,经电泳分离后,找到潜在靶标蛋白所在的差异条带.最后利用质谱技术分析差异条带内的蛋白质,通过分析比对质谱结果得到潜在的靶标蛋白.结果 十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶(SDS-PAGE)找到差异条带,经质谱分析,不含POU结构域的八聚核苷酸结合蛋白(p54nrb/NONO)在核酸适配体LW-25样品组中量极高,在文库对照样品组中蛋白量很少,在琼脂糖凝胶珠样品组中几乎没有,因此判定NONO是最明显的差异蛋白.结论 NONO是LW-25潜在的靶标蛋白并很可能是引起胃癌转移的重要蛋白.

作者:刘浩波;刘涛;王亚雷;罗昭锋

来源:安徽医科大学学报 2019 年 54卷 10期

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作者:
刘浩波;刘涛;王亚雷;罗昭锋
来源:
安徽医科大学学报 2019 年 54卷 10期
标签:
cell-SELEX 核酸适配体 胃癌 转移 靶标蛋白
目的 探索可以特异性识别高转移胃癌细胞(HGC-27)的核酸适配体LW-25的靶标蛋白.方法 合成已知的可以特异性识别HGC-27而不识别无转移能力的胃腺癌细胞的LW-25.首先,通过胰蛋白酶消化细胞来确定核酸适配体结合的靶标类型是蛋白质,然后通过裂解细胞提取出蛋白质.用核酸适配体介导的亲和富集实验富集出LW-25所结合的蛋白,经电泳分离后,找到潜在靶标蛋白所在的差异条带.最后利用质谱技术分析差异条带内的蛋白质,通过分析比对质谱结果得到潜在的靶标蛋白.结果 十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶(SDS-PAGE)找到差异条带,经质谱分析,不含POU结构域的八聚核苷酸结合蛋白(p54nrb/NONO)在核酸适配体LW-25样品组中量极高,在文库对照样品组中蛋白量很少,在琼脂糖凝胶珠样品组中几乎没有,因此判定NONO是最明显的差异蛋白.结论 NONO是LW-25潜在的靶标蛋白并很可能是引起胃癌转移的重要蛋白.

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