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目的 旨在基于代谢组学和转录组学联合分析,探究高原低氧通过NOD样受体信号通路诱导小鼠脾脏组织中炎症反应的潜在分子机制.方法 本研究分别在海拔400 m和4 200 m饲养C57BL/6小鼠,5只/组,30 d后取脾脏组织,通过代谢组和转录组分析筛选差异代谢物和差异表达基因,关联KEGG富集分析,对关键通路中的差异代谢物和差异表达基因构建相关性网络互作图并进行RT-qPCR验证.结果 代谢组学分析发现,在平原常氧组(PSC组)和高原低氧组(HST组)中共筛选出133个差异代谢物,其中上调95个,下调38个,KEGG富集分析,发现主要涉及到NOD样受体信号通路、HIF-1信号通路、胆固醇代谢等多个代谢途径;转录组结果表明,在PSC组和HST组共鉴定4 213个差异表达基因,其中上调基因1 947个,下调基因2 266个,KEGG共富集到173个信号通路,包括NOD样受体信号通路、MAPK信号通路、NF-κB信号通路等多条途径;联合分析表明,差异代谢物与差异表达基因显著富集在NOD样受体信号通路中;因此,对NOD样受体信号通路中的差异代谢物ATP和差异表达基因构建相关性网络互作图.RT-qPCR实验结果表明,与PSC组比较,HST组NOD样受体信号通路中NOD1 和 NOD2 途径相关的 DEGs(CHUK、TAB3、MAPK8)以及NLRP1炎症体-CASP1途径相关的DEGs(NLRP1b、CASP1)表达水平显著增强,且下

作者:王嘉阳;胡英;许玉珍;龙启福;唐超群;永胜

来源:安徽医科大学学报 2023 年 58卷 9期

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作者:
王嘉阳;胡英;许玉珍;龙启福;唐超群;永胜
来源:
安徽医科大学学报 2023 年 58卷 9期
标签:
高原低氧 脾 代谢组学 转录组学 NOD样受体信号通路 plateau hypoxia spleen metabolomics transcriptomics NOD-like receptor signaling pathway
目的 旨在基于代谢组学和转录组学联合分析,探究高原低氧通过NOD样受体信号通路诱导小鼠脾脏组织中炎症反应的潜在分子机制.方法 本研究分别在海拔400 m和4 200 m饲养C57BL/6小鼠,5只/组,30 d后取脾脏组织,通过代谢组和转录组分析筛选差异代谢物和差异表达基因,关联KEGG富集分析,对关键通路中的差异代谢物和差异表达基因构建相关性网络互作图并进行RT-qPCR验证.结果 代谢组学分析发现,在平原常氧组(PSC组)和高原低氧组(HST组)中共筛选出133个差异代谢物,其中上调95个,下调38个,KEGG富集分析,发现主要涉及到NOD样受体信号通路、HIF-1信号通路、胆固醇代谢等多个代谢途径;转录组结果表明,在PSC组和HST组共鉴定4 213个差异表达基因,其中上调基因1 947个,下调基因2 266个,KEGG共富集到173个信号通路,包括NOD样受体信号通路、MAPK信号通路、NF-κB信号通路等多条途径;联合分析表明,差异代谢物与差异表达基因显著富集在NOD样受体信号通路中;因此,对NOD样受体信号通路中的差异代谢物ATP和差异表达基因构建相关性网络互作图.RT-qPCR实验结果表明,与PSC组比较,HST组NOD样受体信号通路中NOD1 和 NOD2 途径相关的 DEGs(CHUK、TAB3、MAPK8)以及NLRP1炎症体-CASP1途径相关的DEGs(NLRP1b、CASP1)表达水平显著增强,且下

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