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目的 探讨甲状腺激素受体相互作用蛋白13(TRIP13)在软组织肉瘤中的表达及临床意义.方法 应用Oncomine、GEPIA、CCLE和Kaplan-Meier Plotter数据库分析TRIP13在软组织肉瘤中的表达及与预后的关系.应用cBioPortal数据库分析软组织肉瘤中TRIP13突变情况及与患者预后的关系.应用String数据库构建蛋白质相互作用网络,应用Metascape数据库进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果 TRIP13在大部分肿瘤中表达水平升高.在软组织肉瘤组织和细胞中,TRIP13表达水平均升高.TRIP13高表达与软组织肉瘤患者的预后差有关.21%的软组织肉瘤患者发生TRIP13基因突变,与TRIP13未突变组患者相比,TRIP13突变组患者的中位总生存期(OS)和中位无病生存期(DFS)均明显较短.应用String数据库共获得10个与TRIP13相互作用的蛋白,这些蛋白主要具有激酶结合、腺苷三磷酸(ATP)酶活性、蛋白激酶活性等生物学功能,主要参与细胞周期、人T细胞白血病病毒1感染、黄体酮介导的卵母细胞成熟、卵母细胞减数分裂及病毒致癌过程.结论 TRIP13在软组织肉瘤组织和细胞中表达水平均较高,其与软组织肉瘤患者的预后有关,有望成为软组织肉瘤诊断和治疗的生物标志物.

作者:于得全;邵秋菊;刘锐;梁军;高宏;屈焕敏

来源:癌症进展 2022 年 20卷 10期

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作者:
于得全;邵秋菊;刘锐;梁军;高宏;屈焕敏
来源:
癌症进展 2022 年 20卷 10期
标签:
甲状腺激素受体相互作用蛋白13 软组织肉瘤 生物信息学 数据挖掘 预后
目的 探讨甲状腺激素受体相互作用蛋白13(TRIP13)在软组织肉瘤中的表达及临床意义.方法 应用Oncomine、GEPIA、CCLE和Kaplan-Meier Plotter数据库分析TRIP13在软组织肉瘤中的表达及与预后的关系.应用cBioPortal数据库分析软组织肉瘤中TRIP13突变情况及与患者预后的关系.应用String数据库构建蛋白质相互作用网络,应用Metascape数据库进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果 TRIP13在大部分肿瘤中表达水平升高.在软组织肉瘤组织和细胞中,TRIP13表达水平均升高.TRIP13高表达与软组织肉瘤患者的预后差有关.21%的软组织肉瘤患者发生TRIP13基因突变,与TRIP13未突变组患者相比,TRIP13突变组患者的中位总生存期(OS)和中位无病生存期(DFS)均明显较短.应用String数据库共获得10个与TRIP13相互作用的蛋白,这些蛋白主要具有激酶结合、腺苷三磷酸(ATP)酶活性、蛋白激酶活性等生物学功能,主要参与细胞周期、人T细胞白血病病毒1感染、黄体酮介导的卵母细胞成熟、卵母细胞减数分裂及病毒致癌过程.结论 TRIP13在软组织肉瘤组织和细胞中表达水平均较高,其与软组织肉瘤患者的预后有关,有望成为软组织肉瘤诊断和治疗的生物标志物.

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