目的:采用生物信息学方法筛选影响肺腺癌(LUAD)的关键基因,分析其生物学功能及其对LUAD预后的影响.方法:于高通量基因表达(GEO)数据库下载GSE118370和GSE136043芯片数据,癌症基因组图谱(TCGA)数据库筛选LUAD相关数据.采用R软件分析共同表达的差异表达基因(DEGs).采用clusterProfile R包对DEGs进行基因本体(GO)功能富集分析,DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络.采用Cytoscape筛选连接度排名前10位的关键基因,GEPIA数据库和人类蛋白质图谱(HPA)数据库分析正常肺组织和LUAD组织中关键基因mRNA和蛋白表达情况及不同分期LUAD组织中关键基因表达情况.关键基因免疫浸润分析和生存分析获取关键基因表达与患者生存期的相关关系.结果:共筛选DEGs 428个.GO分析,LUAD的DEGs在主要富集于上皮-间质转化(EMT)等生物过程(BP)方面、细胞基部等细胞组分(CC)方面和细胞外基质(ECM)结构形成等分子功能(MF)方面.KEGG分析,LUAD的DEGs主要富集于细胞因子受体相互作用通路等方面.筛选DNA拓扑异构酶Ⅱα(TOP2A)、果蝇纺锤体异常基因(ASPM)、细胞周期蛋白B1(CCNB1)、人类细胞分裂周期相关基因8(CDCA8)、含杆状病毒IAP重复序列蛋白5(BIRC5)、苏氨酸激酶(AURKA)
作者：叶汇；孙哲；周丽婷；齐雯；叶琳
来源：吉林大学学报（医学版） 2023 年 49卷 6期
