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目的:通过网络药理学和分子对接技术分析黄芩汤治疗结直肠癌(CRC)的潜在作用靶点,阐明其相关分子机制.方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)构建黄芩汤活性成分和作用靶点数据集,通过GeneCards、人类在线孟德尔遗传(OMIM)、药物遗传学和药物基因组学知识库(PharmGKB)等数据库构建CRC疾病相关靶点数据集.利用R软件、Cytoscape软件和STRING数据库构建药物-疾病靶点交集、黄芩汤中药复方调控网络和蛋白-蛋白互作(PPI)网络.利用R软件和Metascape平台进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.采用AutoDock和PyMol软件进行分子对接验证,评估配受体结合情况.结果:筛选黄芩汤有效活性成分136个,黄芩汤治疗CRC的潜在靶点242个,核心靶点18个,基于信号通路分析获得CRC密切相关核心关键靶点5个,分别为蛋白激酶B1(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、原癌基因FOS、肿瘤蛋白P53(TP53)和原癌基因MYC.GO功能富集分析,主要参与多种细胞应激反应的生物过程.KEGG信号通路富集分析,潜在靶点在癌症通路高度富集;进一步对CRC核心靶点进行KEGG信号通路富集分析,主要涉及内分泌抵抗、细胞凋亡和表皮生长因子受体-酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)抵抗等通路.分子对接验证,黄芩汤

作者:陈霭莹;姜靖雯;张慧

来源:吉林大学学报(医学版) 2024 年 50卷 1期

知识库介绍

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作者:
陈霭莹;姜靖雯;张慧
来源:
吉林大学学报(医学版) 2024 年 50卷 1期
标签:
黄芩汤 网络药理学 分子对接 结直肠肿瘤 槲皮素 Huangqin Tang Network pharmacology Molecular docking Colorectal neoplasm Quercetin
目的:通过网络药理学和分子对接技术分析黄芩汤治疗结直肠癌(CRC)的潜在作用靶点,阐明其相关分子机制.方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)构建黄芩汤活性成分和作用靶点数据集,通过GeneCards、人类在线孟德尔遗传(OMIM)、药物遗传学和药物基因组学知识库(PharmGKB)等数据库构建CRC疾病相关靶点数据集.利用R软件、Cytoscape软件和STRING数据库构建药物-疾病靶点交集、黄芩汤中药复方调控网络和蛋白-蛋白互作(PPI)网络.利用R软件和Metascape平台进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.采用AutoDock和PyMol软件进行分子对接验证,评估配受体结合情况.结果:筛选黄芩汤有效活性成分136个,黄芩汤治疗CRC的潜在靶点242个,核心靶点18个,基于信号通路分析获得CRC密切相关核心关键靶点5个,分别为蛋白激酶B1(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、原癌基因FOS、肿瘤蛋白P53(TP53)和原癌基因MYC.GO功能富集分析,主要参与多种细胞应激反应的生物过程.KEGG信号通路富集分析,潜在靶点在癌症通路高度富集;进一步对CRC核心靶点进行KEGG信号通路富集分析,主要涉及内分泌抵抗、细胞凋亡和表皮生长因子受体-酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)抵抗等通路.分子对接验证,黄芩汤

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