目的 通过生物信息学分析具核梭杆菌(Fusobacterium nucleatum,F.nucleatum,Fn.)对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)差异表达基因(differential expression genes,DEGs)的调控作用,鉴定关键基因在F.nucleatum感染结直肠癌细胞中的表达.方法 利用GEO数据库高通量筛选F.nucleatum诱导的结直肠癌差异表达基因;基因本体论(GO),京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析差异表达基因数据集;Cytoscape软件构建差异表达基因的蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI);RT-qPCR和Western blot验证关键(Hub)基因MUC1在细胞模型中的转录水平和蛋白水平表达.结果 共筛选出118个DEGs,其中20个表达上调,98个下调;GO分析显示DEGs在质膜和质膜的组成部分等细胞成分中富集最显著,KEGG分析发现其在PI3K-Akt、MAPK、Rap1和JAK-STAT等信号通路中有明显富集(P＜0.05).在PPI网络中,Hub基因MUC1具有较高的中心性得分,F.nucleatum感染与MUC1的差异表达显著相关.结论 通过对关键基因的筛选和验证,F.nucleatum感染致CRC的机制可能与MUC1的过表达有关.
作者：叶新力；李静；唐彬；兰远志；罗华星；卢晓雪；向媛媛；张艳；曾冬竹
来源：第三军医大学学报 2021 年 43卷 15期
