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目的 探讨HPV16 E6 对宫颈上皮细胞基因及信号通路的影响,筛选与致癌转化相关的基因.方法 构建HPV16 E6 感染的正常人宫颈上皮细胞(HUCEC)模型,进行转录组测序筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析差异信号通路.采用RT-qPCR验证主要差异下调表达基因.对主要差异基因的蛋白结构与 HPV16 E6 蛋白进行分子对接预测分析,通过RT-qPCR及Western blot验证HUCEC细胞模型中主要差异基因表达情况,并采用RT-qPCR及Western blot实验在宫颈癌细胞系SiHa及CaSki中进一步验证差异基因的表达.结果 共筛选出差异表达 2 倍以上的基因 55 个.本研究聚焦下调差异基因,结果表明:负调控的差异基因GO功能富集于氧化还原过程;KEGG富集分析主要与碳水化合物代谢及癌症等相关.10 个差异基因mRNA下调表达趋势与测序结果基本一致.分子对接预测DHRS2 与HPV16 E6 蛋白存在相互作用.与对照组比较,HUCEC细胞模型中HPV16 E6 下调DHRS2 的mRNA(P<0.01)和蛋白(P<0.05)、ETV5 的蛋白(P<0.01)表达;在SiHa、CaSki细胞系中,与对照组比较,DHRS2 的mRNA及蛋白表达亦明显下调(P<0.05),并与P53 蛋白表达趋势正相关

作者:杜秀蓉;陶沐珩;贾永琴;伍婷婷;凌开建;王延洲;梁志清

来源:第三军医大学学报 2024 年 46卷 7期

知识库介绍

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作者:
杜秀蓉;陶沐珩;贾永琴;伍婷婷;凌开建;王延洲;梁志清
来源:
第三军医大学学报 2024 年 46卷 7期
标签:
HPV16 E6 DHRS2 宫颈上皮细胞 致癌转化 宫颈癌 HPV16 E6 DHRS2 cervical epithelial cells oncogenic transformation cervical cancer
目的 探讨HPV16 E6 对宫颈上皮细胞基因及信号通路的影响,筛选与致癌转化相关的基因.方法 构建HPV16 E6 感染的正常人宫颈上皮细胞(HUCEC)模型,进行转录组测序筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析差异信号通路.采用RT-qPCR验证主要差异下调表达基因.对主要差异基因的蛋白结构与 HPV16 E6 蛋白进行分子对接预测分析,通过RT-qPCR及Western blot验证HUCEC细胞模型中主要差异基因表达情况,并采用RT-qPCR及Western blot实验在宫颈癌细胞系SiHa及CaSki中进一步验证差异基因的表达.结果 共筛选出差异表达 2 倍以上的基因 55 个.本研究聚焦下调差异基因,结果表明:负调控的差异基因GO功能富集于氧化还原过程;KEGG富集分析主要与碳水化合物代谢及癌症等相关.10 个差异基因mRNA下调表达趋势与测序结果基本一致.分子对接预测DHRS2 与HPV16 E6 蛋白存在相互作用.与对照组比较,HUCEC细胞模型中HPV16 E6 下调DHRS2 的mRNA(P<0.01)和蛋白(P<0.05)、ETV5 的蛋白(P<0.01)表达;在SiHa、CaSki细胞系中,与对照组比较,DHRS2 的mRNA及蛋白表达亦明显下调(P<0.05),并与P53 蛋白表达趋势正相关

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