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目的 筛选慢性髓系白血病急性变相关关键基因,探寻疾病进展机制及潜在的生物标志物.方法 应用基因芯片技术筛选与慢性髓系白血病急变期相关基因,采用生物信息学方法对这些差异表达基因进行基因本体分类,亚细胞定位以及组织选择性分析,结合转录因子预测和网络谱图构建,找出差异表达基因中的关键分子并进行初步验证.结果 得到一组定位于白细胞膜的基因集,在整个调控网络中,CD40、CCR3、LGALS3、RGS3、CEACAM3及转录因子RAC1、CTNNB1、TP53、NF-kB处于网络节点位置,可能是疾病进展的关键调控基因,采用RT-PCR方法初步证实CEACAM3、RGS3、CTNNB1和RAC1在急变期患者表达显著增高.结论 CEACAM3、RGS3、CTNNB1和RAC1可能是慢性髓系白血病由慢性期向急变期转变的关键基因和生物标志物.

作者:骆许静;张进芳;刘晓力;杜庆锋;许娜;许露露;黄彬涛;肖小珍

来源:南方医科大学学报 2012 年 32卷 6期

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作者:
骆许静;张进芳;刘晓力;杜庆锋;许娜;许露露;黄彬涛;肖小珍
来源:
南方医科大学学报 2012 年 32卷 6期
标签:
慢性髓系白血病 急变期 基因芯片 生物信息学
目的 筛选慢性髓系白血病急性变相关关键基因,探寻疾病进展机制及潜在的生物标志物.方法 应用基因芯片技术筛选与慢性髓系白血病急变期相关基因,采用生物信息学方法对这些差异表达基因进行基因本体分类,亚细胞定位以及组织选择性分析,结合转录因子预测和网络谱图构建,找出差异表达基因中的关键分子并进行初步验证.结果 得到一组定位于白细胞膜的基因集,在整个调控网络中,CD40、CCR3、LGALS3、RGS3、CEACAM3及转录因子RAC1、CTNNB1、TP53、NF-kB处于网络节点位置,可能是疾病进展的关键调控基因,采用RT-PCR方法初步证实CEACAM3、RGS3、CTNNB1和RAC1在急变期患者表达显著增高.结论 CEACAM3、RGS3、CTNNB1和RAC1可能是慢性髓系白血病由慢性期向急变期转变的关键基因和生物标志物.

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