目的 探究LINC00634在结直肠癌(CRC)中的表达及其与临床病理特征、免疫浸润以及预后的关系.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库官方网站上下载CRC的RNA?seq数据及患者的临床病理信息,使用Mann?Whitney U检验分析CRC组织与正常组织之间的表达差异.分析LINC00634表达与患者临床病理特征的关系,利用Kaplan?Meier法分析LINC00634表达与患者预后的相关性.使用单因素和多因素Cox回归分析LINC00634表达与CRC患者临床预后关系.利用基因富集分析(GSEA)探索LINC00634在CRC中参与的信号途径.使用R 4.0.2软件评估LINC00634表达与肿瘤细胞免疫浸润丰度的相关性.结果 CRC样本中LINC00634表达水平显著高于正常组织,差异有统计学意义(P<0.05),LINC00634的表达与患者的年龄、临床分期和淋巴结转移分期显著相关(χ2=4.326、4.666、6.513,P<0.05).LINC00634高表达组患者的总体生存率显著低于低表达组患者,差异有统计学意义(P<0.05).多因素Cox回归分析显示,LINC00634可以作为CRC患者的独立预后因素(HR=5.377,95%CI:2.218~13.031,P<0.05).GSEA富集分析结果提示,LINC00634主要参与DNA损伤修复、多条生化代谢通路,TGF信号通路,ECM受体相互作用通路等.LINC00634表达与CD8+T细胞、CD4+记忆T细胞呈正相关(R>0,P<0.05),而与嗜酸性
作者:马甜甜;柳家翠;段怡平;陈梁玥;朱翠雯;邹晓沨
来源:分子诊断与治疗杂志 2021 年 13卷 10期