目的 柯萨奇病毒A组 10 型(coxsackievirus A10,CV-A10)是引发手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)的重要病原体之一,此研究运用生物信息学方法预测分析其病毒蛋白(viral protein,VP)中VP1 的理化性质、结构特征以及抗原表位.方法 通过ProtParam、SOPMA、SWISS-MODEL、PDBsum、ProSA-web预测分析CV-A10 VP1 的理化性质和结构特征.应用 DNAstar、ABCpred、Bepipred 2.0、ElliPro、DiscoTope-2.0、NetMHCpan-4.1、NetMHCIIpan-4.0、Consurf、VaxiJen v.2.0、AllerTOP v.2.0、ToxinPred2、IEDB immunogenicity预测分析CV-A10 VP1的抗原表位.结果 CV-A10 VP1 为碱性、不稳定的亲水性蛋白,其二级结构以无规则卷曲为主.该蛋白还存在多个潜在B、T细胞抗原表位以及基于潜在表位之上的优势抗原表位.结论 CV-A10 VP1 蛋白有多处可诱导特异性体液免疫和细胞免疫的潜在位点,研究为其实验鉴定、分子流行病学研究和疫苗研发提供了重要支持.
作者：张高博；刘益文；李子星；刘一洋；袁俊
来源：公共卫生与预防医学 2023 年 34卷 5期
