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目的:基于网络药理学和分子对接方法,研究益气活血方治疗深静脉血栓形成的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、中医药综合数据库(traditional Chinese medicine inte-grated database,TCMID)、Pubchem和Uniprot数据库收集益气活血方的有效成分并规范出靶点,从Gene-Cards数据库筛选出深静脉血栓形成(deep vein thrombosis,DVT)的相关靶点,将两组靶点取交集得到药物-疾病共有靶点;利用STRING平台构建蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interaction,PPI),通过DAVID数据库进行GO分析和KEGG通路富集分析;运用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-成分-靶点-通路网络图;采用autodock vina 1.1.2软件对重要成分和潜在靶点进行分子对接研究.结果:获得益气活血方有效成分155个,潜在作用靶点246个,深静脉血栓形成靶点1977个.益气活血方调治深静脉血栓形成的核心活性成分为槲皮素、β-谷甾醇、异鼠李素、山柰酚等,核心靶点有信号转导及转录激活因子3(signal transduction and activator of transcription 3,STAT3)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、血管内皮生长因子A(vascular en

作者:秦晓慧;罗丹;张力

来源:西部中医药 2023 年 36卷 4期

知识库介绍

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作者:
秦晓慧;罗丹;张力
来源:
西部中医药 2023 年 36卷 4期
标签:
益气活血方 深静脉血栓形成 网络药理学 分子对接
目的:基于网络药理学和分子对接方法,研究益气活血方治疗深静脉血栓形成的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、中医药综合数据库(traditional Chinese medicine inte-grated database,TCMID)、Pubchem和Uniprot数据库收集益气活血方的有效成分并规范出靶点,从Gene-Cards数据库筛选出深静脉血栓形成(deep vein thrombosis,DVT)的相关靶点,将两组靶点取交集得到药物-疾病共有靶点;利用STRING平台构建蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interaction,PPI),通过DAVID数据库进行GO分析和KEGG通路富集分析;运用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-成分-靶点-通路网络图;采用autodock vina 1.1.2软件对重要成分和潜在靶点进行分子对接研究.结果:获得益气活血方有效成分155个,潜在作用靶点246个,深静脉血栓形成靶点1977个.益气活血方调治深静脉血栓形成的核心活性成分为槲皮素、β-谷甾醇、异鼠李素、山柰酚等,核心靶点有信号转导及转录激活因子3(signal transduction and activator of transcription 3,STAT3)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、血管内皮生长因子A(vascular en

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