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目的:基于网络药理学及分子对接技术,探究三棱-莪术药对在辅助治疗卵巢癌中的作用机制.方法:活性成分及其作用靶点收集自中药系统药理学分析平台,卵巢癌相关靶点收集自Genecard数据库.上述靶点取交集后,结合STRING数据库及Cytoscape软件构建PPI网络.应用R及Cytoscape软件整合构建中药-活性成分-疾病-靶点网络.同时,应用R软件进行基因本体论(gene ontology,GO)功能富集、京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集,并通过Cytoscape/CluGO进行KEGG通路聚类分析.综合分析各网络,获取关键靶点及其对应活性成分后应用Autodock vina及Pymol等软件进行分子对接及可视化研究.结果:本研究在三棱-莪术药对中,共获得8个活性成分,164个作用靶点,Genecards数据库获得1540个符合条件的卵巢癌相关靶点.取交集获得27个三棱-莪术药对治疗卵巢癌的潜在靶点.分析PPI网络并获取关键靶点为CASP3、ESR1、JUN、PTGS2、AR、MAPK14、PGR、CASP8、CASP9、CAS及PPARG.GO及KEGG分析表明相关作用机制可能涉及凋亡、白细胞介素17(interleukin-17,IL-17)信号通路、乙肝信号通路、雌激素信号通路、甲状腺激素信号通路,卵巢类固醇等多条信号通路.分子对接表明核心成分芒柄花黄素、β-谷甾醇、常春藤

作者:李鸿博;石丹宁;张杜娟;张璐;李翡

来源:西部中医药 2024 年 37卷 2期

知识库介绍

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作者:
李鸿博;石丹宁;张杜娟;张璐;李翡
来源:
西部中医药 2024 年 37卷 2期
标签:
卵巢癌 三棱 莪术 网络药理学 分子对接 ovarian cancer Sanleng Ezhu network pharmacology molecular docking
目的:基于网络药理学及分子对接技术,探究三棱-莪术药对在辅助治疗卵巢癌中的作用机制.方法:活性成分及其作用靶点收集自中药系统药理学分析平台,卵巢癌相关靶点收集自Genecard数据库.上述靶点取交集后,结合STRING数据库及Cytoscape软件构建PPI网络.应用R及Cytoscape软件整合构建中药-活性成分-疾病-靶点网络.同时,应用R软件进行基因本体论(gene ontology,GO)功能富集、京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集,并通过Cytoscape/CluGO进行KEGG通路聚类分析.综合分析各网络,获取关键靶点及其对应活性成分后应用Autodock vina及Pymol等软件进行分子对接及可视化研究.结果:本研究在三棱-莪术药对中,共获得8个活性成分,164个作用靶点,Genecards数据库获得1540个符合条件的卵巢癌相关靶点.取交集获得27个三棱-莪术药对治疗卵巢癌的潜在靶点.分析PPI网络并获取关键靶点为CASP3、ESR1、JUN、PTGS2、AR、MAPK14、PGR、CASP8、CASP9、CAS及PPARG.GO及KEGG分析表明相关作用机制可能涉及凋亡、白细胞介素17(interleukin-17,IL-17)信号通路、乙肝信号通路、雌激素信号通路、甲状腺激素信号通路,卵巢类固醇等多条信号通路.分子对接表明核心成分芒柄花黄素、β-谷甾醇、常春藤

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