目的:探究NPAS2基因在肺腺癌(LUAD)中的表达及其与相关临床参数的关联,分析其对患者总生存期(OS)的影响及在LUAD预后中的预测价值。方法:从癌症基因组图谱数据库(TCGA)中下载LUAD转录组测序及临床资料数据,分析LUAD肿瘤组织与正常肺组织中NPAS2的表达差异。收集LUAD患者肿瘤组织及正常肺组织应用蛋白免疫印迹法(WB)检测NPAS2蛋白表达,并分析TCGA数据库中NPAS2表达与LUAD患者肿瘤分期及OS的关联。通过基因集富集分析(GSEA)挖掘NPAS2潜在的致癌机制。结果:TCGA差异分析显示NPAS2 mRNA在LUAD肿瘤组织1.83(1.01,3.01)中的表达水平高于正常肺组织,0.74(0.49,1.15),差异有统计学意义(
Z=7.21,
P<0.05);配对分析显示NPAS2 mRNA在LUAD组织1.82(1.37,3.08)中的表达也高于配对的正常肺组织0.76(0.51,1.16),差异有统计学意义(
Z=5.63,
P<0.05)。WB结果显示,NPAS2蛋白在LUAD 0.62(0.40,1.36)中的表达水平高于正常肺组织0.14(0.08,0.58),差异有统计学意义(
Z=2.71,
P<0.05)。在亚组分析中,与T1~2组相比,T3~4组中NPAS2 mRNA高表达的比例更高1.81(1.01,2.92)比2.10(1.29,3.71)(
Z=2.12,
P<0.05);在预后分析中,NPAS2高表达组患者的预后相
作者:许敬平;袁关利;韩卓笑;康小红
来源:国际呼吸杂志 2022 年 42卷 23期