目的:筛选出斑秃的差异表达基因(differentially expressed gene ，DEGs)，探究其免疫浸润机制并预测中药治疗靶点，为斑秃的发病机制和中医治疗探究提供新的思路。方法:从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载斑秃相关基因芯片表达谱；筛选DEGs并进行富集分析；基于String数据库构建蛋白质互作网络(protein-protein interaction，PPI)，并通过Cytoscape软件筛选关键基因；通过CIBERSORT反卷积法分析免疫细胞浸润相关性；利用医学本体信息检索平台Coremine medical数据库筛选关键基因对应的中药靶点。结果:在3个斑秃芯片样本中共筛选出164个DEGs。GO富集分析显示这164个DEGs主要富集在皮肤发育、分子活性、内肽酶抑制物活性、超分子纤维等方面；KEGG富集分析筛选出金黄色葡萄球菌感染、雌激素信号通路、Wnt信号通路、转化生长因子β(TGF-β)等信号通路。通过PPI分析共筛选出 KRT85、BMP2、KRTAP3-1、KRT27、MSX2、KRTAP11-1、HOXC13、DSG4、KRT82、TCHH这10个关键基因。DEGs与免疫浸润细胞相关性分析结果显示，γδT细胞( P<0.001)、M1巨噬细胞( P<0.001)等差异具有统计学意义。通过Coremine medical数据库映射出黄芪( P＝0.0178)、鳖甲( P＝0.0012)、降香( P＝0

作者：王朴；陈东宇；潘素跃；樊文龙；黄巧；胡敏；杨晓雨；王红心；何玉清

来源：国际遗传学杂志 2022 年 45卷 6期