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目的:探讨谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)在结直肠癌组织中的基因表达与生存预后的关系,构建和评价GPX对结直肠癌患者生存预后的列线图预测模型。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载620例结直肠癌患者(结肠癌455例,直肠癌165例)的GPX基因表达数据等临床资料,同时下载820例正常人群的GPX基因表达数据作为对照,经R语言预处理并对基因表达数据进行差异表达分析。利用Spearman秩相关分析肠癌组织中GPX基因表达与肿瘤突变负荷(TMB)的相关性。采用Cox风险回归模型分析结直肠癌患者生存预后的影响因素,构建预测结肠癌、直肠癌患者总生存期(OS)的列线图模型并采用校准曲线评估其预测性能。结果:GPX家族中,GPX1、GPX2、GPX3、GPX4、GPX5、GPX7、GPX8 mRNA在结肠癌患者和正常人群的表达差异具有统计学意义,且结肠癌患者GPX1、GPX2、GPX4、GPX8 mRNA的表达高于正常人群(均 P<0.05);直肠癌患者和正常人群GPX1、GPX2、GPX3、GPX4、GPX7、GPX8 mRNA的表达差异均具有统计学意义,且直肠癌患者GPX1、GPX2、GPX4、GPX7、GPX8 mRNA的表达高于正常人群(均 P<0.05)。Spearman秩相关分析显示,GPX2( r s=-0.27, P<0.001)和GPX7( r s=-0.11, P=0.0

作者:郝海亚;李树林;张荣强;左泽华

来源:国际肿瘤学杂志 2022 年 49卷 10期

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作者:
郝海亚;李树林;张荣强;左泽华
来源:
国际肿瘤学杂志 2022 年 49卷 10期
标签:
结直肠肿瘤 谷胱甘肽过氧化物酶 列线图 Colorectal neoplasms Glutathione peroxidases Nomogram
目的:探讨谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)在结直肠癌组织中的基因表达与生存预后的关系,构建和评价GPX对结直肠癌患者生存预后的列线图预测模型。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载620例结直肠癌患者(结肠癌455例,直肠癌165例)的GPX基因表达数据等临床资料,同时下载820例正常人群的GPX基因表达数据作为对照,经R语言预处理并对基因表达数据进行差异表达分析。利用Spearman秩相关分析肠癌组织中GPX基因表达与肿瘤突变负荷(TMB)的相关性。采用Cox风险回归模型分析结直肠癌患者生存预后的影响因素,构建预测结肠癌、直肠癌患者总生存期(OS)的列线图模型并采用校准曲线评估其预测性能。结果:GPX家族中,GPX1、GPX2、GPX3、GPX4、GPX5、GPX7、GPX8 mRNA在结肠癌患者和正常人群的表达差异具有统计学意义,且结肠癌患者GPX1、GPX2、GPX4、GPX8 mRNA的表达高于正常人群(均 P<0.05);直肠癌患者和正常人群GPX1、GPX2、GPX3、GPX4、GPX7、GPX8 mRNA的表达差异均具有统计学意义,且直肠癌患者GPX1、GPX2、GPX4、GPX7、GPX8 mRNA的表达高于正常人群(均 P<0.05)。Spearman秩相关分析显示,GPX2( r s=-0.27, P<0.001)和GPX7( r s=-0.11, P=0.0

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