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目的 运用网络药理学及分子对接技术,探讨八角茴香挥发油防治新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制.方法 选取4个(松油烯、萜品油烯、桉叶油醇、反式茴香脑)具有生物活性的八角茴香挥发油化合物作为研究对象.通过TCMSP和TCMID检索主要活性成分的靶蛋白,再利用UniProt数据库查询靶蛋白对应的人类基因.在GeneCards、OMIM和CTD数据库中获取COVID-19相关靶点,通过映射后得到共同靶点作为八角茴香挥发油干预COVID-19的潜在作用靶点.针对潜在作用靶点,构建蛋白相互作用(PPI)网络并进行拓扑学分析得到关键靶点,同时进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.对主要活性成分与关键靶点[前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、JUN]、新型冠状病毒3CL水解酶(Mpro)、新型冠状病毒受体血管紧张素转化酶2(ACE2)之间进行分子对接验证.结果 共获得26个八角茴香挥发油干预COVID-19的潜在作用靶点,PPI网络分析得到8个关键靶点.GO功能富集分析提示,潜在作用靶点主要位于细胞膜筏、膜微区等部位,参与有机羟基化合物转运、对有毒物质反应等生物过程,涉及核受体活性及转录因子活性等分子功能;KEGG通路富集结果显示,潜在作用靶点主要涉及PTGS2、JUN、核因子κB相关蛋白、基质金属蛋白酶等通路.

作者:黄丹娜;陈路

来源:广西医学 2021 年 43卷 6期

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黄丹娜;陈路
来源:
广西医学 2021 年 43卷 6期
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新型冠状病毒肺炎 八角茴香 挥发油 作用机制 网络药理学 分子对接 防治
目的 运用网络药理学及分子对接技术,探讨八角茴香挥发油防治新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制.方法 选取4个(松油烯、萜品油烯、桉叶油醇、反式茴香脑)具有生物活性的八角茴香挥发油化合物作为研究对象.通过TCMSP和TCMID检索主要活性成分的靶蛋白,再利用UniProt数据库查询靶蛋白对应的人类基因.在GeneCards、OMIM和CTD数据库中获取COVID-19相关靶点,通过映射后得到共同靶点作为八角茴香挥发油干预COVID-19的潜在作用靶点.针对潜在作用靶点,构建蛋白相互作用(PPI)网络并进行拓扑学分析得到关键靶点,同时进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.对主要活性成分与关键靶点[前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、JUN]、新型冠状病毒3CL水解酶(Mpro)、新型冠状病毒受体血管紧张素转化酶2(ACE2)之间进行分子对接验证.结果 共获得26个八角茴香挥发油干预COVID-19的潜在作用靶点,PPI网络分析得到8个关键靶点.GO功能富集分析提示,潜在作用靶点主要位于细胞膜筏、膜微区等部位,参与有机羟基化合物转运、对有毒物质反应等生物过程,涉及核受体活性及转录因子活性等分子功能;KEGG通路富集结果显示,潜在作用靶点主要涉及PTGS2、JUN、核因子κB相关蛋白、基质金属蛋白酶等通路.

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