目的:初步探讨长链非编码RNA(lncRNA)在研究头颈鳞癌(HNSCC)放疗中的作用.方法:将HNSCC-SCCⅦ细胞分为对照组(不予放疗)和实验组(予放疗干预),应用芯片技术,筛选出放疗干预后HNSCC-SCCⅦ细胞中差异表达的lncRNA及mRNA,通过Cis和Trans法对靶基因进行预测,应用DAVID软件进行KEGG通路筛选,得到对应的靶基因富集的KEGG通路包括肿瘤相关通路、Wnt信号通路及轴突导向通路,分析这3条通路上对应的靶基因,并找到与这些靶基因对应的lncRNA.结果:筛选出1 280条放疗差异表达的lncRNA,对照组相对实验组高表达5倍以上的共15条,低表达5倍以上的共8条;筛选发现表达差异的mRNA有1 087条,对照组相对实验组高表达的528条,对照组相对实验组低表达559条;KEGG通路信息分析lncRNA对应的靶基因富集于肿瘤相关通路、Wnt信号通路和轴突导向通路;Wnt信号通路中靶基因PRKCA和STAT5B对应的lncRNA与mRNA是共表达的,对应的16203-3lncRNA在对照组的表达为实验组的3.176倍(P＜0.05),对应的31238-3lncRNA在实验组中的表达量为对照组中的2.037倍(P＜0.05).结论:PRKCA和STA T5B可能是控制HNSCC放疗反应敏感性的靶基因,对应的16203-3lncRNA和31238-3lncRNA可作为调控HNSCC放疗敏感性的候选lncRNA.
作者：叶惠平；易烛光；龚正鹏
来源：贵阳医学院学报 2016 年 41卷 2期
