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目的 分析近年湖北省麻疹病毒流行株基因型别以及血凝素蛋白(H)基因特性.方法 对2012-2013年麻疹病毒核酸检测阳性的患者标本,直接提取核酸,采用one-step逆转录一聚合酶链反应方法扩增核蛋白(N)和血凝素蛋白(H)基因,测序后进行同源性和进化分析.结果 湖北省麻疹病毒流行株主要为H1基因型的H1a亚型,发现一株D8基因亚型.与中国麻疹疫苗株上海191株的N和H基因比较,其核苷酸同源性分别为91.6%~92.4%和94.6%~94.8%.对湖北省H1a亚型麻疹病毒H基因进化分析发现均属lineage 3b,H蛋白序列分析发现第240和第397位氨基酸分别发生Ser→Asn、Pro→Leu的变异.运用贝叶斯中的马尔科夫链的蒙特卡洛方法,估计H1a基因亚型H基因核苷酸的平均碱基替代率为7.619×10-4取代/位点/年,估算其共同祖先大约出现在1980年.结论 湖北省2012-2013年麻疹病毒流行株主要H1a基因型,仅1例D8亚型;与中国疫苗株沪191株相比较,两者在基因特性上存在明显差异,需进一步加强对麻疹病毒基因型别和变异程度的监测.

作者:李静;李国明;雷亚克;杨朝晖;张婷;占建波

来源:中华疾病控制杂志 2015 年 19卷 8期

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作者:
李静;李国明;雷亚克;杨朝晖;张婷;占建波
来源:
中华疾病控制杂志 2015 年 19卷 8期
标签:
麻疹病毒 核蛋白 血凝素蛋白 基因进化 Measles viruses Nucleoprotein Hemagglutinin Genetic evolution
目的 分析近年湖北省麻疹病毒流行株基因型别以及血凝素蛋白(H)基因特性.方法 对2012-2013年麻疹病毒核酸检测阳性的患者标本,直接提取核酸,采用one-step逆转录一聚合酶链反应方法扩增核蛋白(N)和血凝素蛋白(H)基因,测序后进行同源性和进化分析.结果 湖北省麻疹病毒流行株主要为H1基因型的H1a亚型,发现一株D8基因亚型.与中国麻疹疫苗株上海191株的N和H基因比较,其核苷酸同源性分别为91.6%~92.4%和94.6%~94.8%.对湖北省H1a亚型麻疹病毒H基因进化分析发现均属lineage 3b,H蛋白序列分析发现第240和第397位氨基酸分别发生Ser→Asn、Pro→Leu的变异.运用贝叶斯中的马尔科夫链的蒙特卡洛方法,估计H1a基因亚型H基因核苷酸的平均碱基替代率为7.619×10-4取代/位点/年,估算其共同祖先大约出现在1980年.结论 湖北省2012-2013年麻疹病毒流行株主要H1a基因型,仅1例D8亚型;与中国疫苗株沪191株相比较,两者在基因特性上存在明显差异,需进一步加强对麻疹病毒基因型别和变异程度的监测.

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