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应用抑制性消减杂交技术构建丙型肝炎病毒非结构蛋白5A(HCV NS5A)反式激活基因差异表达的cDNA消减文库,克隆HCV NS5A蛋白反式激活相关基因.以HCV NS5A表达质粒pcDNA3.1(一)-NS5A转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(一)为对照,制备转染后的细胞裂解液,提取mRNA并逆转录为cDNA,经RsaI酶切后,将实验组cDNA分成两组,分别与两种不同的接头衔接,再与对照组cDNA进行两次消减杂交及两次抑制性PCR,将产物与T/A载体连接,构建cDNA消减文库,并转染大肠杆菌进行文库扩增,随机挑选克隆PCR扩增后进行测序及同源性分析.文库扩增后得到121个阳性克隆,经菌落PCR分析,得到115个200~1 000bp的插入片段,对其中的90个片段测序,并进行同源性分析,显示31种已知基因编码蛋白和15种未知功能基因序列,包括一些与细胞周期、细胞凋亡、信号传导及肿瘤发生等细胞生长调节密切相关的蛋白编码基因,可能是NS5A反式激活靶基因.结果提示,成功构建了HCVNS5A反式激活基因差异表达的cDNA消减文库,该文库的建立为进一步阐明HCV NS5A反式调节的靶基因及致肝细胞癌发生的分子生物学机制提供了理论依据.

作者:刘妍;陆荫英;成军;王建军;李莉;张玲霞

来源:解放军医学杂志 2003 年 28卷 1期

知识库介绍

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作者:
刘妍;陆荫英;成军;王建军;李莉;张玲霞
来源:
解放军医学杂志 2003 年 28卷 1期
标签:
丙型肝炎病毒 非结构蛋白NS5A 反式激活 抑制性消减杂交
应用抑制性消减杂交技术构建丙型肝炎病毒非结构蛋白5A(HCV NS5A)反式激活基因差异表达的cDNA消减文库,克隆HCV NS5A蛋白反式激活相关基因.以HCV NS5A表达质粒pcDNA3.1(一)-NS5A转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(一)为对照,制备转染后的细胞裂解液,提取mRNA并逆转录为cDNA,经RsaI酶切后,将实验组cDNA分成两组,分别与两种不同的接头衔接,再与对照组cDNA进行两次消减杂交及两次抑制性PCR,将产物与T/A载体连接,构建cDNA消减文库,并转染大肠杆菌进行文库扩增,随机挑选克隆PCR扩增后进行测序及同源性分析.文库扩增后得到121个阳性克隆,经菌落PCR分析,得到115个200~1 000bp的插入片段,对其中的90个片段测序,并进行同源性分析,显示31种已知基因编码蛋白和15种未知功能基因序列,包括一些与细胞周期、细胞凋亡、信号传导及肿瘤发生等细胞生长调节密切相关的蛋白编码基因,可能是NS5A反式激活靶基因.结果提示,成功构建了HCVNS5A反式激活基因差异表达的cDNA消减文库,该文库的建立为进一步阐明HCV NS5A反式调节的靶基因及致肝细胞癌发生的分子生物学机制提供了理论依据.

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