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目的 了解鹿茸再生及快速生长过程中基因和蛋白的动态变化,阐明鹿茸生长发育机制.方法 以梅花鹿(Cervus nippon Temminck)的鹿茸[初生期(PS)、快速生长期(RG)、骨化期(OS)鹿茸组织]作为实验材料,基于Illumina Hiseq和iTRAQ技术在转录和蛋白水平进行分析,根据差异基因和差异蛋白结果筛选与鹿茸再生和快速生长有关的基因和蛋白.结果 2组分别得到11294(PSvsRG)和4924(PSvsOS)个显著差异基因(DEGs),2组的蛋白组数据显示,分别得到236、211个差异蛋白(DAPs),相关性分析显示转录组和蛋白组数据相关性分析呈弱相关.在2组中分别有54、51个DEGs编码了其相应的DAPs,其中,在2组中分别得到35和20个在转录组和蛋白组中调节方向相同的DEGs和相应的DAPs.对候选基因/蛋白进行KEGG富集分析,分别富集到10和12个信号通路.其中,2组共同富集到的通路包括:血管平滑肌收缩、p53信号通路、黏着斑、蛋白质消化吸收、TGF-β信号通路、ECM-受体相互作用信号通路.只富集到快速生长期的信号通路包括:戊糖磷酸途径、糖酵解/糖异生、果糖和甘露糖代谢及代谢途径.只富集到骨化期的信号通路包括:破骨细胞分化、肌动蛋白细胞骨架的调节、紧密连接、RNA转运、mRNA监测途径信号通路.共有10个候选基因/蛋白(CALD1、THBS2S、COL9A、ALDO、COL1A、

作者:慧芳;孙天霞;薛东明;姜英男;赵雨

来源:吉林中医药 2022 年 42卷 8期

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慧芳;孙天霞;薛东明;姜英男;赵雨
来源:
吉林中医药 2022 年 42卷 8期
标签:
梅花鹿 转录组测序 蛋白组 iTRAQ定量分析技术 鹿茸再生
目的 了解鹿茸再生及快速生长过程中基因和蛋白的动态变化,阐明鹿茸生长发育机制.方法 以梅花鹿(Cervus nippon Temminck)的鹿茸[初生期(PS)、快速生长期(RG)、骨化期(OS)鹿茸组织]作为实验材料,基于Illumina Hiseq和iTRAQ技术在转录和蛋白水平进行分析,根据差异基因和差异蛋白结果筛选与鹿茸再生和快速生长有关的基因和蛋白.结果 2组分别得到11294(PSvsRG)和4924(PSvsOS)个显著差异基因(DEGs),2组的蛋白组数据显示,分别得到236、211个差异蛋白(DAPs),相关性分析显示转录组和蛋白组数据相关性分析呈弱相关.在2组中分别有54、51个DEGs编码了其相应的DAPs,其中,在2组中分别得到35和20个在转录组和蛋白组中调节方向相同的DEGs和相应的DAPs.对候选基因/蛋白进行KEGG富集分析,分别富集到10和12个信号通路.其中,2组共同富集到的通路包括:血管平滑肌收缩、p53信号通路、黏着斑、蛋白质消化吸收、TGF-β信号通路、ECM-受体相互作用信号通路.只富集到快速生长期的信号通路包括:戊糖磷酸途径、糖酵解/糖异生、果糖和甘露糖代谢及代谢途径.只富集到骨化期的信号通路包括:破骨细胞分化、肌动蛋白细胞骨架的调节、紧密连接、RNA转运、mRNA监测途径信号通路.共有10个候选基因/蛋白(CALD1、THBS2S、COL9A、ALDO、COL1A、

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