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目的 分析爪蟾驱动蛋白样蛋白2靶蛋白(TPX2)在肝细胞癌(HCC)的表达及其临床预后的意义.方法 首先,分别利用UALCAN、K-M Plot以及HPA数据库分析TPX2在HCC的表达水平、生存预后及其相关性;再次,利用TIMER、GEPIA和SangerBox数据库分析TPX2的免疫细胞浸润以及与TP53突变相关性和突变景观图;最后,通过HCCDB数据库分析在HCC中TPX2的共表达基因及其预后价值,并对共表达基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析.结果 TPX2在HCC高表达且不利于患者的总体生存(OS)、疾病特异性生存(DSS)、无进展生存(PFS)和无复发生存(RFS);同时,TPX2在HCC组织与肿瘤细胞纯度和多种免疫细胞(B细胞、CD4+T以及CD8+T等)显著相关;并且,TPX2在HCC中的表达水平与TP53突变显著相关.TPX2对HCC患者1年、3年和5年OS预后诊断的受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)分别是0.73,95%CI(0.669~0.79)、0.668,95%CI(0.604~0.732)和 0.654,95%CI(0.574~0.734).TPX2 的共表达基因在 HCC 均不利于患者的OS;其GO功能主要富集在有丝分裂与核分裂、微管细胞骨架以及微管运动等,KEGG主要富集在细胞周期、卵母细胞减数分裂以及p53信号等通路上,且对HCC患者1年、3年和5年OS预后诊断的ROC曲线下面积AUC 分别是 0.801,95%CI(0.745~

作者:安韶光;马俊杰;张浩轩;陆进

来源:解剖学报 2023 年 54卷 4期

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作者:
安韶光;马俊杰;张浩轩;陆进
来源:
解剖学报 2023 年 54卷 4期
标签:
爪蟾驱动蛋白样蛋白2靶蛋白 无病生存 肝细胞癌 生物信息学 数据库分析 Targeting protein for xenopus kinesin-like protein 2 Disease-free survival Hepatocellular carcinoma Bioinformatics Database analysis
目的 分析爪蟾驱动蛋白样蛋白2靶蛋白(TPX2)在肝细胞癌(HCC)的表达及其临床预后的意义.方法 首先,分别利用UALCAN、K-M Plot以及HPA数据库分析TPX2在HCC的表达水平、生存预后及其相关性;再次,利用TIMER、GEPIA和SangerBox数据库分析TPX2的免疫细胞浸润以及与TP53突变相关性和突变景观图;最后,通过HCCDB数据库分析在HCC中TPX2的共表达基因及其预后价值,并对共表达基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析.结果 TPX2在HCC高表达且不利于患者的总体生存(OS)、疾病特异性生存(DSS)、无进展生存(PFS)和无复发生存(RFS);同时,TPX2在HCC组织与肿瘤细胞纯度和多种免疫细胞(B细胞、CD4+T以及CD8+T等)显著相关;并且,TPX2在HCC中的表达水平与TP53突变显著相关.TPX2对HCC患者1年、3年和5年OS预后诊断的受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)分别是0.73,95%CI(0.669~0.79)、0.668,95%CI(0.604~0.732)和 0.654,95%CI(0.574~0.734).TPX2 的共表达基因在 HCC 均不利于患者的OS;其GO功能主要富集在有丝分裂与核分裂、微管细胞骨架以及微管运动等,KEGG主要富集在细胞周期、卵母细胞减数分裂以及p53信号等通路上,且对HCC患者1年、3年和5年OS预后诊断的ROC曲线下面积AUC 分别是 0.801,95%CI(0.745~

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