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目的 研发能特异性结合穿孔素的DNA适配体并构建适配体电化学传感器,为发展穿孔素的新型检测技术提供基础.方法 体外合成全长为81个碱基并含有35个随机寡核苷酸的单链DNA文库,库容量大约为1×1010,以穿孔素蛋白为靶标,利用指数富集配体系统进化技术(SELEX),从单链DNA文库中筛选能够结合穿孔素蛋白的DNA适配体;采用M-fold程序(version 3.2)预测二级结构;设计并构建适配体电化学传感器,进行穿孔素电化学特异性检测,绘制标准曲线.结果 经多轮筛选,获得6条穿孔素蛋白的DNA适配体,分别为序列SEQ1~SEQ6,适配体SEQ6能够特异性结合穿孔素,并可通过电化学方法用于检测穿孔素,而其与牛血清清蛋白、γ-干扰素、肿瘤坏死因子α结合较弱.该电化学传感器检测穿孔素的线性水平范围为1~20 nmol,检出限为0.7 nmol.结论 成功利用SELEX筛选获得特异结合穿孔素的DNA适配体,其在研发针对穿孔素的新型检测技术方面具有应用潜能.

作者:孟凡飞;刘畅;蒋栋能;张立群;蒲晓允

来源:检验医学与临床 2017 年 14卷 22期

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作者:
孟凡飞;刘畅;蒋栋能;张立群;蒲晓允
来源:
检验医学与临床 2017 年 14卷 22期
标签:
穿孔素 适配体 指数富集配体系统进化技术 perforin aptamers SELEX
目的 研发能特异性结合穿孔素的DNA适配体并构建适配体电化学传感器,为发展穿孔素的新型检测技术提供基础.方法 体外合成全长为81个碱基并含有35个随机寡核苷酸的单链DNA文库,库容量大约为1×1010,以穿孔素蛋白为靶标,利用指数富集配体系统进化技术(SELEX),从单链DNA文库中筛选能够结合穿孔素蛋白的DNA适配体;采用M-fold程序(version 3.2)预测二级结构;设计并构建适配体电化学传感器,进行穿孔素电化学特异性检测,绘制标准曲线.结果 经多轮筛选,获得6条穿孔素蛋白的DNA适配体,分别为序列SEQ1~SEQ6,适配体SEQ6能够特异性结合穿孔素,并可通过电化学方法用于检测穿孔素,而其与牛血清清蛋白、γ-干扰素、肿瘤坏死因子α结合较弱.该电化学传感器检测穿孔素的线性水平范围为1~20 nmol,检出限为0.7 nmol.结论 成功利用SELEX筛选获得特异结合穿孔素的DNA适配体,其在研发针对穿孔素的新型检测技术方面具有应用潜能.

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