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长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200 nt的非编码RNA基因,在生物体内具有重要的生物学功能,近年来逐渐引起人们的重视.利用生物信息学预测流程,可以从RNA-seq测序数据中发现大量的lncRNA基因.迄今为止,已在果蝇、家蚕、褐飞虱等11种昆虫中发现了47049个lncRNA基因.目前lncRNA的分类标准尚未统一,有的根据其在基因组上的位置进行分类,有的根据其长度大小进行分类,也有的根据其功能进行分类.研究发现,大量的lncRNA在果蝇形态转变的关键时期、小菜蛾抗药性品系、褐飞虱高繁殖力种群及埃及伊蚊感病毒细胞中高水平表达,显示其在昆虫变态发育、抗药性形成、繁殖力和抗病毒中具有重要的功能.lncRNA还参与调控昆虫剂量补偿效应、睡眠行为、性别决定等重要生命活动过程.本文简要综述了lncRNA的分类、预测、昆虫lncRNA的发现、昆虫lncRNA功能研究的最新进展.

作者:肖花美;李美珍;李飞

来源:应用昆虫学报 2017 年 54卷 1期

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作者:
肖花美;李美珍;李飞
来源:
应用昆虫学报 2017 年 54卷 1期
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昆虫 长链非编码RNA 预测 功能 insect lncRNA prediction function analysis
长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200 nt的非编码RNA基因,在生物体内具有重要的生物学功能,近年来逐渐引起人们的重视.利用生物信息学预测流程,可以从RNA-seq测序数据中发现大量的lncRNA基因.迄今为止,已在果蝇、家蚕、褐飞虱等11种昆虫中发现了47049个lncRNA基因.目前lncRNA的分类标准尚未统一,有的根据其在基因组上的位置进行分类,有的根据其长度大小进行分类,也有的根据其功能进行分类.研究发现,大量的lncRNA在果蝇形态转变的关键时期、小菜蛾抗药性品系、褐飞虱高繁殖力种群及埃及伊蚊感病毒细胞中高水平表达,显示其在昆虫变态发育、抗药性形成、繁殖力和抗病毒中具有重要的功能.lncRNA还参与调控昆虫剂量补偿效应、睡眠行为、性别决定等重要生命活动过程.本文简要综述了lncRNA的分类、预测、昆虫lncRNA的发现、昆虫lncRNA功能研究的最新进展.

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