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目的 对3例无创产前筛查(non-invasive prenatal screening,NIPS)诊断为假阴性的病例进行分析,分析假阴性发生原因,总结NIPS在临床应用中的局限性.方法 对3例经染色体核型分析确诊为NIPS假阴性的样本行实验室质量控制;备份血浆、文库和白细胞样本采用飞行时间质谱检测进行混样排查;备份血浆分别使用Complete Genomics技术与Ion Torrent半导体测序平台复测;提高测序深度行扩展性无创产前筛查(NIPS-Plus)检测;备份母体白细胞及胎盘样本行低深度全基因组拷贝数变异(copy number variations,CNVs)检测.结果 3例样本文库和白细胞来源一致,未发生混样;备份血浆经原平台复测、更换半导体测序平台及NIPS-Plus检测后,3例病例均仍为低风险;备份白细胞未发现有1 M以上的缺失/重复;样本2胎盘胶囊制品经CNVs检测提示存在24%~25%的chr21三体嵌合.结论 提高测序深度及更换不同检测平台未能避免假阴性.胎儿游离DNA浓度低、胎盘低比例嵌合是样本2发生假阴性的主要原因.

作者:王杰;董弘;武丽琼;郭志远;安槿;张丽春;徐睿廷;王晓华;贾跃旗

来源:临床检验杂志 2020 年 38卷 9期

知识库介绍

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作者:
王杰;董弘;武丽琼;郭志远;安槿;张丽春;徐睿廷;王晓华;贾跃旗
来源:
临床检验杂志 2020 年 38卷 9期
标签:
无创产前筛查 假阴性 胎儿游离DNA 胎盘嵌合
目的 对3例无创产前筛查(non-invasive prenatal screening,NIPS)诊断为假阴性的病例进行分析,分析假阴性发生原因,总结NIPS在临床应用中的局限性.方法 对3例经染色体核型分析确诊为NIPS假阴性的样本行实验室质量控制;备份血浆、文库和白细胞样本采用飞行时间质谱检测进行混样排查;备份血浆分别使用Complete Genomics技术与Ion Torrent半导体测序平台复测;提高测序深度行扩展性无创产前筛查(NIPS-Plus)检测;备份母体白细胞及胎盘样本行低深度全基因组拷贝数变异(copy number variations,CNVs)检测.结果 3例样本文库和白细胞来源一致,未发生混样;备份血浆经原平台复测、更换半导体测序平台及NIPS-Plus检测后,3例病例均仍为低风险;备份白细胞未发现有1 M以上的缺失/重复;样本2胎盘胶囊制品经CNVs检测提示存在24%~25%的chr21三体嵌合.结论 提高测序深度及更换不同检测平台未能避免假阴性.胎儿游离DNA浓度低、胎盘低比例嵌合是样本2发生假阴性的主要原因.

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