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目的 通过对GEO数据库中糖尿病心肌病(DCM)的基因芯片进行分析,筛选出DCM的关键基因并探索潜在的靶向药物.方法 从GEO数据库中下载基因表达数据集GSE161052和GSE161931.选取基因集进行差异基因分析,构建加权基因共表达网络.使用String软件进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析.使用Cibersort工具评估免疫细胞在样本中的浸润比例.使用DGIdb数据库搜索靶向生物标志物的潜在药物.结果 FKBP5、CYP2B6和RET是DCM的关键基因.NTN1与SLIT3、CYP1B1与CYP2B2具有较强的相互作用.RET与NK细胞呈正相关(P<0.05);FKBP5与CD8+T细胞、T细胞共抑制细胞、Th1呈负相关(P<0.05);CYP2B6与B细胞、Ⅱ型INF呈负相关(P<0.05).蒿甲醚、氯氮平和AST-487的活性成分分别与CYP2B6、FKBP5和RET基因靶点结合时显示出最强的结合活性.结论 FKBP5、CYP2B6和RET通过不同分子途径在DCM的发生发展中起着关键作用.蒿甲醚、氯氮平和AST-487可能是治疗DCM的潜在靶向药物.

作者:邓亮;段一镟;孙婧靓;刘畅;邓捷;王梓铭

来源:临床军医杂志 2023 年 51卷 11期

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作者:
邓亮;段一镟;孙婧靓;刘畅;邓捷;王梓铭
来源:
临床军医杂志 2023 年 51卷 11期
标签:
糖尿病心肌病 GEO数据库 网络药理学 分子对接 Diabetic cardiomyopathy GEO database Network pharmacology Molecular docking
目的 通过对GEO数据库中糖尿病心肌病(DCM)的基因芯片进行分析,筛选出DCM的关键基因并探索潜在的靶向药物.方法 从GEO数据库中下载基因表达数据集GSE161052和GSE161931.选取基因集进行差异基因分析,构建加权基因共表达网络.使用String软件进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析.使用Cibersort工具评估免疫细胞在样本中的浸润比例.使用DGIdb数据库搜索靶向生物标志物的潜在药物.结果 FKBP5、CYP2B6和RET是DCM的关键基因.NTN1与SLIT3、CYP1B1与CYP2B2具有较强的相互作用.RET与NK细胞呈正相关(P<0.05);FKBP5与CD8+T细胞、T细胞共抑制细胞、Th1呈负相关(P<0.05);CYP2B6与B细胞、Ⅱ型INF呈负相关(P<0.05).蒿甲醚、氯氮平和AST-487的活性成分分别与CYP2B6、FKBP5和RET基因靶点结合时显示出最强的结合活性.结论 FKBP5、CYP2B6和RET通过不同分子途径在DCM的发生发展中起着关键作用.蒿甲醚、氯氮平和AST-487可能是治疗DCM的潜在靶向药物.

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