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目的 探讨肝癌中长链非编码RNA TP73-AS1差异表达,及其对肝癌细胞凋亡的影响与作用机制.方法 从TCGA数据库中下载并处理新一代测序(RNASEQ)数据,利用生物信息学方法获取显著的肝癌相关IncRNA与mRNA的共表达网络.将差异表达IncRNA映射入上述网络中,利用生物信息学方法预测肝癌相关IncRNA及其功能.通过MTT、AO/EB、Western blot方法对其功能学进行研究.结果 共识别25 439对显著的IncRNA-gene共表达关系.在22个差异的IncRNAs被映射中,TP73-AS1度最高,该IncRNA的62个互作基因映射到病毒致癌作用(Viral carcinogenesis pathway)通路中,并能影响下游MAPK信号通路与p53信号通路.In-cRNA TP73-AS1-siRNA影响HepG-2细胞增殖,上调促凋亡蛋白Bax表达,增加Caspase-3活性,下调抗凋亡蛋白Bcl-2表达,使p53蛋白表达升高.结论 IncRNA TP73-AS1通过p53途径调节肝细胞癌细胞系HepG-2凋亡,为长链非编码RNA成为临床肝细胞癌患者的有效治疗药物提供了实验依据.

作者:张会瑞;焦军东

来源:实用药物与临床 2016 年 19卷 8期

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作者:
张会瑞;焦军东
来源:
实用药物与临床 2016 年 19卷 8期
标签:
长链非编码RNA 共表达网络 肝细胞癌 凋亡 Long non-coding RNA Co-expression network Hepatocellular carcinoma Apoptosis
目的 探讨肝癌中长链非编码RNA TP73-AS1差异表达,及其对肝癌细胞凋亡的影响与作用机制.方法 从TCGA数据库中下载并处理新一代测序(RNASEQ)数据,利用生物信息学方法获取显著的肝癌相关IncRNA与mRNA的共表达网络.将差异表达IncRNA映射入上述网络中,利用生物信息学方法预测肝癌相关IncRNA及其功能.通过MTT、AO/EB、Western blot方法对其功能学进行研究.结果 共识别25 439对显著的IncRNA-gene共表达关系.在22个差异的IncRNAs被映射中,TP73-AS1度最高,该IncRNA的62个互作基因映射到病毒致癌作用(Viral carcinogenesis pathway)通路中,并能影响下游MAPK信号通路与p53信号通路.In-cRNA TP73-AS1-siRNA影响HepG-2细胞增殖,上调促凋亡蛋白Bax表达,增加Caspase-3活性,下调抗凋亡蛋白Bcl-2表达,使p53蛋白表达升高.结论 IncRNA TP73-AS1通过p53途径调节肝细胞癌细胞系HepG-2凋亡,为长链非编码RNA成为临床肝细胞癌患者的有效治疗药物提供了实验依据.

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