目的 基于生物信息学筛选脓毒症中性粒细胞活化的关键基因.方法 从GEO数据库中下载4 个成人脓毒症芯片数据集(GSE69528、GSE28750、GSE57065、GSE95233),进行差异表达基因(DEG)筛选.基因本体论(GO)分析DEG,STRING数据库构建蛋白互作网络,Cytoscape软件提取关键基因,CIBERSORT算法估算数据集中的免疫细胞表达水平,ROC 曲线评价关键基因对脓毒症患者的诊断价值.取儿童脓毒症相关芯片数据集(GSE66099)进行验证.结果 4 个成人脓毒症数据集筛选出299 个重叠DEG,其中112 个基因上调,187 个基因下调.GO主要富集于中性粒细胞活化、中性粒细胞脱颗粒、肽酶调节活性、糖胺聚糖结合、特殊颗粒、囊泡腔等.筛选出脓毒症中性粒细胞活化的关键基因10 个,在脓毒症中表达水平均上调,ROC曲线下面积均大于0.7,具有较好的诊断价值.儿童脓毒症数据集验证结果与成人脓毒症数据集结果一致.结论 基于生物信息学方法筛选出脓毒症中性粒细胞活化相关的10 个关键基因,为脓毒症的早期诊断、预后判断及治疗提供了潜在新靶点.
作者：陆洲成；钟树武；言彩红；张群峰
来源：中南医学科学杂志 2023 年 51卷 6期
