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目的 明确同型半胱氨酸(homocysteine,Hcy)对人源血管平滑肌细胞(vascular smooth muscle cell,VSMC)增殖迁移的影响以及分析Hcy干预下VSMC增殖迁移相关差异miRNAs,为探讨Hcy促VSMC增殖迁移的分子机制提供依据.方法 体外培养VSMC,分为Control组和 100 μmol·L-1 Hcy组.采用CCK-8 法测量VSMC的增殖活性;采用划痕实验分析VSMC在 0h和 48h的迁移情况.高通量测序分析各组VSMC中差异化表达的miRNAs,采用miRanda和TargetScan软件进行靶基因预测,使用BLAST软件将预测靶基因序列与GO和KEGG数据库比对,分析靶基因的功能,获得与VSMC增殖和迁移相关的靶基因信息.通过RT-qPCR对其中表达上调的miRNAs进行验证.结果 Hcy干预能增加VSMC的增殖活力(P<0.01),且VSMC的划痕面积减少(P<0.01).两组细胞共检测到 576 个miRNAs,其中已知miRNAs 404 个,新预测miRNAs 172 个.与Control组相比,Hcy组存在 88 个差异表达的miRNAs,其中表达上调的 20 个,表达下调的 68 个.与VSMC增殖和迁移相关的miRNAs有 20 个,表达上调的包括miRNA39、miR NA206 和miRNA212-5p,表达下调的包括miR NA35等17个.RT-qPCR结果显示,Hcy组miRNA212-5p的表达上调(P<0.05).结论 Hcy致VSMC增殖迁移过程中存在差异表达的miRNAs,miR NA212-5p可能参与了Hcy对V

作者:马星;桂娜;马婷;王秀玉;莫廷润;张鸣号

来源:宁夏医科大学学报 2024 年 46卷 1期

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作者:
马星;桂娜;马婷;王秀玉;莫廷润;张鸣号
来源:
宁夏医科大学学报 2024 年 46卷 1期
标签:
微小RNA 靶基因预测 高通量测序 同型光胱氨酸 血管平滑肌细胞 miRNAs target gene prediction high-throughput sequencing homocysteine vascular smooth mus-cle cell
目的 明确同型半胱氨酸(homocysteine,Hcy)对人源血管平滑肌细胞(vascular smooth muscle cell,VSMC)增殖迁移的影响以及分析Hcy干预下VSMC增殖迁移相关差异miRNAs,为探讨Hcy促VSMC增殖迁移的分子机制提供依据.方法 体外培养VSMC,分为Control组和 100 μmol·L-1 Hcy组.采用CCK-8 法测量VSMC的增殖活性;采用划痕实验分析VSMC在 0h和 48h的迁移情况.高通量测序分析各组VSMC中差异化表达的miRNAs,采用miRanda和TargetScan软件进行靶基因预测,使用BLAST软件将预测靶基因序列与GO和KEGG数据库比对,分析靶基因的功能,获得与VSMC增殖和迁移相关的靶基因信息.通过RT-qPCR对其中表达上调的miRNAs进行验证.结果 Hcy干预能增加VSMC的增殖活力(P<0.01),且VSMC的划痕面积减少(P<0.01).两组细胞共检测到 576 个miRNAs,其中已知miRNAs 404 个,新预测miRNAs 172 个.与Control组相比,Hcy组存在 88 个差异表达的miRNAs,其中表达上调的 20 个,表达下调的 68 个.与VSMC增殖和迁移相关的miRNAs有 20 个,表达上调的包括miRNA39、miR NA206 和miRNA212-5p,表达下调的包括miR NA35等17个.RT-qPCR结果显示,Hcy组miRNA212-5p的表达上调(P<0.05).结论 Hcy致VSMC增殖迁移过程中存在差异表达的miRNAs,miR NA212-5p可能参与了Hcy对V

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