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目的 了解2014年北京市丰台区流行的麻疹野毒株的优势基因型别及特征,为进一步的麻疹防治策略提供科学依据.方法 采集2014年北京市丰台辖区内疑似麻疹暴发和散发患者咽拭子标本,使用Vero/SLAM细胞分离麻疹病毒.通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)从分离到的麻疹病毒中扩增出核蛋白(nucleoprotein,N)基因C末端676个核苷酸片段,再对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析,并以C末端450个核苷酸片段构建基因亲缘关系树,进行核苷酸、氨基酸同源性分析.结果 共分离到38株麻疹病毒,均为H1a基因型.38株麻疹病毒野毒株间的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.7%~100%、96.6%~ 100%;同源性最高的为H1a参考株Chin9322,核苷酸和氨基酸同源性分别为98.4%~99.1%、96.6%~99.3%;与2013年Beijing株(KJ556889/KJ556890/KJ556891)核苷酸和氨基酸同源性分别为97.7%~99.7%、97.3%~100%.结论 2014年北京市丰台区内流行的麻疹病毒野毒株优势基因型别为H1a型.

作者:余红;秦萌;尉秀霞;邢洪光;董晓根;李洁

来源:热带医学杂志 2016 年 16卷 2期

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作者:
余红;秦萌;尉秀霞;邢洪光;董晓根;李洁
来源:
热带医学杂志 2016 年 16卷 2期
标签:
麻疹病毒 N基因 基因型 序列分析 Measles virus N gene Genotype Sequence analysis
目的 了解2014年北京市丰台区流行的麻疹野毒株的优势基因型别及特征,为进一步的麻疹防治策略提供科学依据.方法 采集2014年北京市丰台辖区内疑似麻疹暴发和散发患者咽拭子标本,使用Vero/SLAM细胞分离麻疹病毒.通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)从分离到的麻疹病毒中扩增出核蛋白(nucleoprotein,N)基因C末端676个核苷酸片段,再对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析,并以C末端450个核苷酸片段构建基因亲缘关系树,进行核苷酸、氨基酸同源性分析.结果 共分离到38株麻疹病毒,均为H1a基因型.38株麻疹病毒野毒株间的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.7%~100%、96.6%~ 100%;同源性最高的为H1a参考株Chin9322,核苷酸和氨基酸同源性分别为98.4%~99.1%、96.6%~99.3%;与2013年Beijing株(KJ556889/KJ556890/KJ556891)核苷酸和氨基酸同源性分别为97.7%~99.7%、97.3%~100%.结论 2014年北京市丰台区内流行的麻疹病毒野毒株优势基因型别为H1a型.

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